Selective NMR labelling as a tool for characterization of protein complexes involved in neurodegenerative diseases.
Public support
Provider
Ministry of Education, Youth and Sports
Programme
INTER-EXCELLENCE
Call for proposals
INTER-EXCELLENCE 10 (SMSM2018LTA02)
Main participants
Masarykova univerzita / Středoevropský technologický institut
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
MSMT-39022/2018-1
Alternative language
Project name in Czech
Selektivní NMR značení jako nástroj pro charakterizaci proteinových komplexů zapojených do neurodegenerativních onemocnění
Annotation in Czech
Cílem projektu je implementace fluorovou roztokovou NMR spektroskopie na Tau a Map2c protein a její využití ve třech oblastech: 1) Charakterizace efektu fosforylace na 19F NMR signály. 2) Studiu interakčních vlastností Tau a Map2c proteinů s jejich vazebnými partnery – 14-3-3 proteinem a SH3 doménou plektinu. Hlavním předmětem studia budou vazebná místa a vazebná afinita do těchto míst. 3) Monitorování oligomerizace Tau a Map2c proteinů. Stanovení kinetiky oligomerizace a oblastí největších konformačních změn.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
OECD FORD - main branch
10608 - Biochemistry and molecular biology
OECD FORD - secondary branch
10403 - Physical chemistry
OECD FORD - another secondary branch
10610 - Biophysics
CEP - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
BO - Biophysics<br>CE - Biochemistry<br>CF - Physical chemistry and theoretical chemistry<br>EB - Genetics and molecular biology
Completed project evaluation
Provider evaluation
V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)
Project results evaluation
Protocols for 19F labeling of different aromatic residues within Tau and its binding partner 14-3-3 protein were optimized, and the individual signals within the 19F NMR spectra were assigned. Subsequently, 19F NMR spectroscopy was successfully applied for the monitoring of oligomeric and conformational changes as well as of the interaction properties. Experimental NMR data were complemented by the computational simulations.
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2019
Realization period - end
Dec 31, 2022
Project status
U - Finished project
Latest support payment
Mar 1, 2022
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP23-MSM-LT-U
Data delivery date
Jun 30, 2023
Finance
Total approved costs
6,620 thou. CZK
Public financial support
6,620 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK