Fluorine NMR spectroscopy as an efficient tool for the interaction analysis of multivalent proteins
Public support
Provider
Ministry of Education, Youth and Sports
Programme
—
Call for proposals
SMSM2026LU001
Main participants
Masarykova univerzita / Přírodovědecká fakulta
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
MSMT-6303/2026-22
Alternative language
Project name in Czech
Fluorová NMR spektroskopie jako efektivní nástroj pro analýzu interakcí multivalentních proteinů
Annotation in Czech
Navrhovaný projekt rozvíjí spolupráci mezi týmem doc. Jozefa Hritze z Masarykovy univerzity v Brně a skupinou strukturní biologie prof. Angely Gronenborn z University of Pittsburgh. Cílem je výměna a aplikace metod 19F NMR pro detailní studium 14-3-3 proteinů a lektinů ze strukturní rodiny AAL. 14-3-3 proteiny regulují aktivitu stovek proteinů v eukaryotických buňkách a hrají významnou roli v neurodegenerativních i onkologických procesech, jejichž mechanismy však nejsou plně objasněny. U lidí existuje sedm izoforem tvořících homo- i heterodimery, přičemž heterodimery jsou dosud málo prozkoumané. Projekt se zaměří na jejich charakterizaci pomocí 19F-Trp NMR. Dále bude studována rovnováha mezi monomerní a dimerní formou a chaperonová funkce těchto proteinů, včetně jejich vlivu na agregaci proteinů spojených s neurodegenerací (např. tau či α-synuklein). Projekt se také věnuje lektinům RSL a AFL, které se podílejí na infekci hostitelů vazbou na sacharidy na buněčném povrchu. AFL obsahuje šest neekvivalentních vazebných míst, jejichž individuální afinity dosud nebyly určeny, zatímco RSL představuje jednodušší systém se dvěma typy míst. Pomocí 19F NMR bude možné určit vazebné vlastnosti jednotlivých míst, což přispěje k vývoji inhibitorů a biotechnologickým aplikacím. Studium těchto proteinů je limitováno složitostí NMR spekter, kterou lze překonat značením izotopem 19F. Tým prof. Gronenborn vyvinul metodiky selektivního značení a jejich využití při studiu proteinových komplexů, např. u HIV. Tyto postupy budou implementovány pro analýzu konformačních změn a oligomerizace 14-3-3 proteinů. Výsledky budou doplněny experimenty s paramagnetickým relaxačním zesílením (PRE). Metodika 19F NMR má široké uplatnění při studiu biomakromolekul i mimo rámec projektu.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
OECD FORD - main branch
10610 - Biophysics
OECD FORD - secondary branch
10608 - Biochemistry and molecular biology
OECD FORD - another secondary branch
10403 - Physical chemistry
CEP - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
BO - Biophysics<br>CE - Biochemistry<br>CF - Physical chemistry and theoretical chemistry<br>EB - Genetics and molecular biology
Solution timeline
Realization period - beginning
Mar 1, 2026
Realization period - end
Dec 31, 2029
Project status
Z - Beginning multi-year project
Latest support payment
—
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP26-MSM-LU-R
Data delivery date
Apr 24, 2026
Finance
Total approved costs
8,484 thou. CZK
Public financial support
8,484 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK