Atomic-resolution characterization of microtubule associated protein 2c (MAP2c) and of modifications regulating its function
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Standard projects
Call for proposals
Standardní projekty 19 (SGA0201500001)
Main participants
Masarykova univerzita / Středoevropský technologický institut
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
15-14974S
Alternative language
Project name in Czech
Charakterizace proteinu MAP2c (microtubule associated protein 2c) a modifikací regulujících jeho funkci s atomovým rozlišením
Annotation in Czech
Přirozeně neuspořádané proteiny (PNP) jsou makromolekuly zajímavé z biofyzikálního i fyziologického pohledu, ale obtížně studovatelné stávajícími biofyzikálními metodami. Nukleární magnetická rezonance (NMR) je klíčovou metodou studia PNP s atomovým rozlišením, ale její použitelnost je omezena překryvy ve spektrech dlouhých nebo vysoce repetitivních aminokyselinových sekvencí. Naše skupina v poslední době vyvinula metodologii NMR s vysokým rozlišením, která překonává toto omezení a umožňuje studovat velké PNP. Navrhujeme použít tuto metodu pro studium proteinu MAP2c (microtubule associated protein 2c), 49 kDa PNP podílejícího se na rané fázi iniciace neuritů. Náš cíl je poskytnout detailní biofyzikální popis MAP2c, zahrnující vyhodnocení flexibility jednotlivých reziduí a jejich tendence tvořit přechodné kontakty a sekundární struktury. Fosforylace MAP2c a jejich význam pro vazbu regulačního proteinu 14-3-3 budou charakterizovány a korelovány se schopností MAP2c interagovat s F-aktinem, sledovanou pomocí kryo-elektronové mikroskopie.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
CEP classification - main branch
BO - Biophysics
CEP - secondary branch
—
CEP - another secondary branch
—
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
10610 - Biophysics
Completed project evaluation
Provider evaluation
U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)
Project results evaluation
Project was devoted to biophysical characterisation of intrinsically disordered protein MAP2c by means of scattering techniques and NMR spectroscopy. Its transient structural properties and peptide backbone dynamics were described. Moreover, phosphorylation sites and its interaction with 14-3-3 protein was characterised. Project results were published in two articles.
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2015
Realization period - end
Dec 5, 2018
Project status
U - Finished project
Latest support payment
Apr 5, 2017
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP19-GA0-GA-U/01:1
Data delivery date
Jun 12, 2019
Finance
Total approved costs
6,460 thou. CZK
Public financial support
6,460 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK