Atomic-resolution characterization of microtubule associated protein 2c (MAP2c) and of modifications regulating its function
Project goals
Intrinsically disordered proteins (IDPs) are macromolecules interesting both form biophysical and physiological point of view, but difficult to study by the current biophysical methods. Nuclear magnetic resonance (NMR) is a key technique of atomic-resolution studies of IDPs, but its applicability is limited by a spectral overlap in case of long or highly repetitive amino-acid sequences. Our group recently developed high-resolution NMR methodology that overcomes this limitation and makes studies of large IDPs possible. We propose to apply the methodology to microtubule associated protein 2c (MAP2c), a 49 kDa IDP involved in an early step of neurite initiation. Our goal is to provide a detailed biophysical description of MAP2c, including evaluation of flexibility of individual residues and their propensities to form transient contacts and secondary structures. MAP2c phosphorylation and its importance for binding to the regulatory protein 14-3-3 will be characterized and correlated with the ability of MAP2c interact with F-actin, monitored by cryo-electron microscopy.
Keywords
intrinsically disordered proteinsmicrotubule associated protein 2cprotein 14-3-3phosphorylationactinnuclear magnetic resonanceelectron microscopymass spectrometry
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Standard projects
Call for proposals
Standardní projekty 19 (SGA0201500001)
Main participants
Masarykova univerzita / Středoevropský technologický institut
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
15-14974S
Alternative language
Project name in Czech
Charakterizace proteinu MAP2c (microtubule associated protein 2c) a modifikací regulujících jeho funkci s atomovým rozlišením
Annotation in Czech
Přirozeně neuspořádané proteiny (PNP) jsou makromolekuly zajímavé z biofyzikálního i fyziologického pohledu, ale obtížně studovatelné stávajícími biofyzikálními metodami. Nukleární magnetická rezonance (NMR) je klíčovou metodou studia PNP s atomovým rozlišením, ale její použitelnost je omezena překryvy ve spektrech dlouhých nebo vysoce repetitivních aminokyselinových sekvencí. Naše skupina v poslední době vyvinula metodologii NMR s vysokým rozlišením, která překonává toto omezení a umožňuje studovat velké PNP. Navrhujeme použít tuto metodu pro studium proteinu MAP2c (microtubule associated protein 2c), 49 kDa PNP podílejícího se na rané fázi iniciace neuritů. Náš cíl je poskytnout detailní biofyzikální popis MAP2c, zahrnující vyhodnocení flexibility jednotlivých reziduí a jejich tendence tvořit přechodné kontakty a sekundární struktury. Fosforylace MAP2c a jejich význam pro vazbu regulačního proteinu 14-3-3 budou charakterizovány a korelovány se schopností MAP2c interagovat s F-aktinem, sledovanou pomocí kryo-elektronové mikroskopie.
Scientific branches
Completed project evaluation
Provider evaluation
U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)
Project results evaluation
Project was devoted to biophysical characterisation of intrinsically disordered protein MAP2c by means of scattering techniques and NMR spectroscopy. Its transient structural properties and peptide backbone dynamics were described. Moreover, phosphorylation sites and its interaction with 14-3-3 protein was characterised. Project results were published in two articles.
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2015
Realization period - end
Dec 5, 2018
Project status
U - Finished project
Latest support payment
Apr 5, 2017
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP19-GA0-GA-U/01:1
Data delivery date
Jun 12, 2019
Finance
Total approved costs
6,460 thou. CZK
Public financial support
6,460 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK
Basic information
Recognised costs
6 460 CZK thou.
Public support
6 460 CZK thou.
100%
Provider
Czech Science Foundation
CEP
BO - Biophysics
Solution period
01. 01. 2015 - 05. 12. 2018