Characterization of intrinsically disordered proteins
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
—
Call for proposals
—
Main participants
Masarykova univerzita / Středoevropský technologický institut
Contest type
M2 - International cooperation
Contract ID
20-05789L
Alternative language
Project name in Czech
Charakterizace přirozeně neuspořádaných proteinů
Annotation in Czech
Vnitřně neuspořádané proteiny (IDP) jsou biopolymery zajímavé z biofyzikálního i fyziologického hlediska, zároveň je však obtížné je studovat pomocí dostupných metod. Tyto proteiny nemohou být popsány jedinou reprezentativní strukturou, ale je třeba je popisovat celým souborem konformací. Počítačové simulace a nukleární magnetická rezonance (NMR) jsou klíčovými technikami pro studium IDP na atomární úrovni. Pro kvantifikaci změn v konformačních souborech budeme používat techniku lokálně zvýšeného vylepšeného vzorkování stupňů volnosti proteinové páteře, abychom mohli vzorkovat více konformačních stavů zároveň. Získané výsledky budou validovány pomocí srovnání s daty z NMR experimentů. Budeme studovat regulační doménu tyrosin hydroxylasy pomocí mnoha experimentálních a výpočetních technik, abychom mohli porozumět změnám v konformačních souborech, které jsou klíčové pro funkci této domény. Mezi další proteiny, na které se zaměříme, budou protein asociovaný s mikrotubuly (MAP2c) a jeho homolog tau protein.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
OECD FORD - main branch
10610 - Biophysics
OECD FORD - secondary branch
—
OECD FORD - another secondary branch
—
CEP - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
BO - Biophysics
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2020
Realization period - end
Dec 31, 2022
Project status
—
Latest support payment
May 19, 2022
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP23-GA0-GF-R
Data delivery date
Jun 26, 2023
Finance
Total approved costs
8,686 thou. CZK
Public financial support
8,686 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK