Characterization of MAGE proteins: cofactors for E3 ubiquitin ligases?
Public support
Provider
Academy of Sciences of the Czech Republic
Programme
Grants of distinctly investigative character focused on the sphere of research pursued at present particularly in the Academy of Sciences of the Czech Republic
Call for proposals
Výzkumné granty 9 (SAV02009-A)
Main participants
—
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
IAA501630902
Alternative language
Project name in Czech
Charakterizace MAGE proteinů: kofaktory E3 ubiquitin ligáz?
Annotation in Czech
Lidské buňky jsou schopné exprimovat 35 různých MAGE (Melanoma antigen) proteinů. MAGEG1-Nse1 heterodimer je součástí Smc5-6 komplexu, který se účastní opravy poškozené DNA. Kromě Nse1, který obsahuje RING-finger E3 ubiquitin ligasovou doménu, existují další dva příklady MAGE-RING finger interakcí. Pokus o predikci struktury MAGE homologní domény (MHD) naznačil její částečnou podobnost s doménou molekuly cullinu, který tvoří E3 ubiquitin ligasový komplex. V tomto projektu chceme ověřit hypotézu: "MAGE proteiny slouží jako kofaktory E3 RING ubiquitin ligás." Budeme mutovat konzervované aminokyselinové zbytky MAGEG1 proteinu tak, abychom zjistili, které z nich se podílí na interakci s Nse1. U specifických mutant budeme sledovat schopnost komplexu Smc5-6učastnit se opravy DNA. Najdeme další RING finger proteiny a podrobíme je podobné analýze s cílem charakterizovat obecné interakční vlastnosti MAGE proteinů. Strukturu MHD budeme studovat pomocí NMR spektroskopie a difrakce krystalů.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
CEP classification - main branch
EB - Genetics and molecular biology
CEP - secondary branch
CE - Biochemistry
CEP - another secondary branch
—
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>30101 - Human genetics
Completed project evaluation
Provider evaluation
V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)
Project results evaluation
A conserved hydrophobic pocket was discovered on the surface of the Nse3/MAGE proteins. The Nse4/EID domain binding to the Nse3/MAGE pocket was described. New interactions between the MAGE and RING-finger proteins were identified and characterized.
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2009
Realization period - end
Dec 31, 2011
Project status
U - Finished project
Latest support payment
Mar 18, 2011
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP12-AV0-IA-U/02:2
Data delivery date
Jun 28, 2013
Finance
Total approved costs
2,893 thou. CZK
Public financial support
2,893 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK