Role of the SMC5/6 complex and its interaction partners in DNA damage repair
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Standard projects
Call for proposals
SGA0202000001
Main participants
Masarykova univerzita / Přírodovědecká fakulta
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
20-05095S
Alternative language
Project name in Czech
Úloha komplexu SMC5/6 a jeho interakčních partnerů v opravě poškozené DNA
Annotation in Czech
Rostliny vyvinuli mnoho strategií k ochraně integrity svých genomů vůči různým environmentálním stresům. Nejškodlivější poškození, vznikající například při ionizujícím záření, jsou dvouřetězcové zlomy (DSB), jelikož způsobují závažnou nestabilitu karyotypu pokud nejsou opraveny. Mezi klíčové faktory udržující integritu genomů patří komplexy SMC (Structural Maintenance of Chromosomes). Pro opravu poškozené DNA je důležitý komplex SMC5/6. U tohoto komplexu však stále není zcela jasné jakým způsobem se podílí na procesech opravy poškozené DNA. Proto budeme v tomto projektu zkoumat úlohu SMC5/6 v DNA opravných mechanismech s využitím mechorostu P. patens, který má vysokou hladinu homologní rekombinace. Budeme také hledat takové interakční partnery komplexu SMC5/6, kteří směřují jeho lokalizaci do míst s poškozenou DNA, především DSB míst. Předpokládáme, že mezi takové interakční partnery patří BRCT proteiny, které se vážou na fosforylované histony H2AX akumulující se v okolí poškozené DNA. Interakce H2AX-BRCT s SMC5/6 by mohly zprostředkovat jeho lokalizaci do míst s poškozenou DNA.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
OECD FORD - main branch
10611 - Plant sciences, botany
OECD FORD - secondary branch
—
OECD FORD - another secondary branch
—
CEP - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
EF - Botany
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2020
Realization period - end
Dec 31, 2022
Project status
—
Latest support payment
Apr 1, 2022
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP23-GA0-GA-R
Data delivery date
Jun 26, 2023
Finance
Total approved costs
9,153 thou. CZK
Public financial support
9,120 thou. CZK
Other public sources
39 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK