Role of Nse proteins, subunits of the SMC5/6 complex, in stabilization and processing of stalled replication forks
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Standard projects
Call for proposals
Standardní projekty 17 (SGA0201300005)
Main participants
Masarykova univerzita / Středoevropský technologický institut
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
13-00774S
Alternative language
Project name in Czech
Úloha proteinů Nse, podjednotek komplexu SMC5/6, v procesech stabilizujících pozastavené replikační vidlice
Annotation in Czech
Proteinové komplexy SMC5/6 se podílí na mnoha procesech od segregace chromosomů, opravy DNA, stabilizace a restartu zastavené replikační vidlice (RF). Komplexy se skládají z 6 konzervovaných podjednotek, z nichž Nse1, Nse3 a Nse4 vytváří stabilní Nse1/3/4 podkomplexy. Strukturní analýza proteinů Nse3 naznačila existenci DNA-vazebné domény. Prokázali jsme, že lidské hNSE3(MAGEG1) proteiny a jejich hNSE1/hNSE3 dimery interagují s DNA. V tomto projektu využijeme lidské i kvasinkové proteiny k analýze interakcí komplexů Nse1/3/4 s různými DNA substráty. Zjistíme, které aminokyseliny se na této vazbě podílí. Nalezneme vztah mezi DNA vazebnými schopnostmi (in vitro) a funkcí Nse1/3/4 při stabilizaci a zpracování zastavených RF v buňkách kvasinky S. pombe. Dále budeme charakterizovat vazbu Nse3 s Fml1 helikázou a její úlohu při zpracování RF. Výsledky našeho projektu přinesou nové poznatky o důležitých interakcích Nse1/3/4 a především o funkčním vztahu mezi SMC5/6 a Fml1(FancM) helikázou, která je spojovaná s Fanconi anemii a rakovinným bujením.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
CEP classification - main branch
CE - Biochemistry
CEP - secondary branch
EB - Genetics and molecular biology
CEP - another secondary branch
—
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>30101 - Human genetics
Completed project evaluation
Provider evaluation
V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)
Project results evaluation
Impact for the field is noticeable. The Applicant reached more than he proposed including new properties of Nse1/Nse3/Nse4 subcomplex. Characterization of the project is reasonable and correct. Outcome of the project is excellent even if the paper in Chem Rev is not considered (too general for the scopes). I did not find any discrepancy at the financial or the scientific level.
Solution timeline
Realization period - beginning
Feb 1, 2013
Realization period - end
Dec 31, 2016
Project status
U - Finished project
Latest support payment
Apr 5, 2016
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP17-GA0-GA-U/03:1
Data delivery date
Jun 28, 2017
Finance
Total approved costs
7,346 thou. CZK
Public financial support
7,346 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK