Probing specific interactions of well-defined glycosaminoglycans with European Lyme disease borrelia adhesins at atomic resolution
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
International projects
Call for proposals
SGA0202300002
Main participants
Jihočeská univerzita v Českých Budějovicích / Přírodovědecká fakulta
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
23-06525J
Alternative language
Project name in Czech
Specifické interakce adhesinů evropských spirochet Lymské boreliózy s glykosyaminoglykany s přesně definovanou strukturou v atomárním rozlišení
Annotation in Czech
V projektu popíšeme specifické interakce syntetických glykosaminoglykanů (GAG) s decorin-vázajícími proteiny (Dbp) z původce Lymské boreliózy, Borrelia burgdorferi. Tyto proteiny mají významnou roli v rozšíření a virulenci bakterií v hostiteli. Interagující části molekul budou studovány metodami nukleární magnetické resonance (NMR) s atomárním rozlišením nejenom proteinů ale poprvé také glykanů. Toto je umožněno stereospecifickou chemickou syntézou glykosaminoglykanů, která umožňuje značení isotopy (13C a 15N). V tomto bilaterálním projektu budeme využívat syntetické GAGy s přesně definovanou délkou řetězce, sekvencí monosacharidů, stareochemií i vzorcem sulfatace, při studiu jejich vazebných afinit s jednotlivými Dbp, včetně strukturní analýzy plně isotopicky značených GAG-Dbp komplexů. Toto bude umožněno spoluprací odborníků na chemickou syntézu oligosacharidů (partner z Tchajwanu) a vedců s velkými zkušenostmi v biochemii lektinů borelií i NMR analýzou z České republiky.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
OECD FORD - main branch
10608 - Biochemistry and molecular biology
OECD FORD - secondary branch
—
OECD FORD - another secondary branch
—
CEP - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
CE - Biochemistry<br>EB - Genetics and molecular biology
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2023
Realization period - end
Dec 31, 2025
Project status
B - Running multi-year project
Latest support payment
Apr 24, 2023
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP24-GA0-GC-R
Data delivery date
Jul 7, 2024
Finance
Total approved costs
9,583 thou. CZK
Public financial support
9,583 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK