Molecular fingerprinting of oil seed rape (Brassica napus) genome and molecular characterization of varieties and breeiding material of Brassica crops.
Project goals
This grant project is directed into utilization of techniques of plant molecular biology in practical plant breeding - for genotype identification, characterization od doubled haploid plants and breeding lines of oil seed rape and other Brassica crops. The aim of this project is optimizing methods of molecular analysis of Brassica plants and application of these techniques in practical plant breeding, seed production and state testing system. Two different ways for production specific molecular markerswill be analyzed: 1/ the study of natural DNA polymorphism using technique of RAPD markers and 2/ more specific protocol based on utilization of PCR reaction with specific primers from GenBank database and detection of markers using TGGE-PCR. The technology of genomic fingerprinting and different biochemical and DNA markers should be incorporated into description system used for characterization of cultivated varieties, newly bred materials and breeding lines in Brassica crops. Molecular mar
Keywords
Public support
Provider
Ministry of Agriculture
Programme
—
Call for proposals
—
Main participants
Jihočeská univerzita v Českých Budějovicích / Fakulta zemědělská a technologická
Contest type
—
Contract ID
—
Alternative language
Project name in Czech
Využití analýzy genomu Brassica napus pomocí molekulárního fingerprintingu pro charakterizaci odrůd a šlechtitelského materiálu brukvovitých plodin.
Annotation in Czech
Předkládaný projekt zasahuje do oblasti využití technik molekulární genetiky pro účely identifikace genotypů (molekulární nebo DNA fingerprinting) pro účely charakterizace dihaploidních linií a odrůd řepky a dalších brukvovitých plodin, šlechtitelských materiálů a novošlechtění. Cílem projektu je vypracování metodiky molekulární analýzy genotypů brukvovitých plodin a aplikace této techniky ve spolupráci s ostatními řešitelskými pracovišti do praktického šlechtění a semenářství, případně kontrolního a zkušebního systému. Během řešení projektu budou zkoumány dva metodické způsoby pro vývoj specifických genomových markerů, pomocí kterých by se mohl charakterizovat zkoumaný materiál. První způsob je založen na studiu přirozeného DNA polymorfismu pomocí techniky RAPD markerů. Druhý způsob je více specifický a je založen na využití PCR reakce s primery s větší specifitou, konstruovaných na základě známých sekvencí genomu brukvovitých rostlin popsaných v GenBank Database. Tyto techniky umož
Scientific branches
R&D category
—
CEP classification - main branch
EB - Genetics and molecular biology
CEP - secondary branch
GE - Plant cultivation
CEP - another secondary branch
—
10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)
10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)
10605 - Developmental biology
10608 - Biochemistry and molecular biology
10609 - Biochemical research methods
30101 - Human genetics
40105 - Horticulture, viticulture
40106 - Agronomy, plant breeding and plant protection; (Agricultural biotechnology to be 4.4)
Completed project evaluation
Provider evaluation
V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)
Project results evaluation
Byly získány metodické předpoklady pro fingerprinting brukvovitých plodin, jejich markerování a monitoring na bázi molekulárních genetických merkerů.
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 1996
Realization period - end
Jan 1, 1999
Project status
U - Finished project
Latest support payment
—
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP/2000/MZE/MZE0QA/U/5:1
Data delivery date
—
Finance
Total approved costs
1,916 thou. CZK
Public financial support
1,601 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK
Basic information
Recognised costs
1 916 CZK thou.
Public support
1 601 CZK thou.
83%
Provider
Ministry of Agriculture
CEP
EB - Genetics and molecular biology
Solution period
01. 01. 1996 - 01. 01. 1999