Novel approaches for effective analysis and mapping of genomes in cultivated plants
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
—
Call for proposals
—
Main participants
Ústav experimentální botaniky AV ČR, v. v. i.
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
—
Alternative language
Project name in Czech
Nové metody pro efektivní studium a mapování genomů kulturních rostlin
Annotation in Czech
Projekt je zaměřen na strukturní analýzu a mapování genomů vyšších rostlin novými a účinnějšími metodickými postupy. Budou vyvinuty nebo zdokonaleny techniky pro konstrukci chromozómově specifických knihoven DNA, cílenou izolaci markerů z vybraných oblastí genomu a přípravu komplexních sond pro celé chromozómy, a to u ekonomicky významných druhů obilovin (Zea mays, Secale cereale, Hordeum vulgare and Triticum aestivum), leguminóz (Vicia faba, Pisum sativum, Medicago sativa), smrku ztepilého (Picea abies) a knotovky bílé (Melandrium album). Projekt je založen na mezioborovém přístupu, kombinujícím klasickou genetiku a cytogenetiku s průtokovou cytometrií (izolace chromozómů a separace jejich jednotlivých typů), molekulárními technikami (izolace, klonování a sekvenování DNA) a molekulární cytogenetikou (in situ hybridizace a chromosome painting). Konečným cílem je využití chromozómově specifických knihoven, markerů a komplexních sond pro zahuštění a zpřesnění genetických map, izolaci a lokalizaci
Scientific branches
R&D category
—
CEP classification - main branch
GE - Plant cultivation
CEP - secondary branch
EF - Botany
CEP - another secondary branch
EI - Biotechnology and bionics
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
10611 - Plant sciences, botany<br>10612 - Mycology<br>20801 - Environmental biotechnology<br>20802 - Bioremediation, diagnostic biotechnologies (DNA chips and biosensing devices) in environmental management<br>20803 - Environmental biotechnology related ethics<br>20901 - Industrial biotechnology<br>20902 - Bioprocessing technologies (industrial processes relying on biological agents to drive the process) biocatalysis, fermentation<br>20903 - Bioproducts (products that are manufactured using biological material as feedstock) biomaterials, bioplastics, biofuels, bioderived bulk and fine chemicals, bio-derived novel materials<br>30401 - Health-related biotechnology<br>30402 - Technologies involving the manipulation of cells, tissues, organs or the whole organism (assisted reproduction)<br>30403 - Technologies involving identifying the functioning of DNA, proteins and enzymes and how they influence the onset of disease and maintenance of well-being (gene-based diagnostics and therapeutic interventions [pharmacogenomics, gene-based therapeutics])<br>30404 - Biomaterials (as related to medical implants, devices, sensors)<br>30405 - Medical biotechnology related ethics<br>40105 - Horticulture, viticulture<br>40106 - Agronomy, plant breeding and plant protection; (Agricultural biotechnology to be 4.4)<br>40401 - Agricultural biotechnology and food biotechnology<br>40402 - GM technology (crops and livestock), livestock cloning, marker assisted selection, diagnostics (DNA chips and biosensing devices for the early/accurate detection of diseases) biomass feedstock production technologies, biopharming<br>40403 - Agricultural biotechnology related ethics
Completed project evaluation
Provider evaluation
U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)
Project results evaluation
Cíl komplexního (6ti letého) projektu, vypracování a zavedení nových metod analýzy genomu byl splněn. Průtoková cytometrie a třídění chromosomů pomůže dalšímu rozvoji genomiky v ČR. Významnou součástí projektu byla výchova studentů na jednotlivých pracov
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 1996
Realization period - end
Jan 1, 2001
Project status
U - Finished project
Latest support payment
—
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP/2002/GA0/GA02GV/U/N/4:2
Data delivery date
Nov 19, 2002
Finance
Total approved costs
37,935 thou. CZK
Public financial support
26,482 thou. CZK
Other public sources
10,486 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK