Evolutionary and ecological factors in genome evolution of bacterial symbionts in insects.
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Standard projects
Call for proposals
Standardní projekty 17 (SGA0201300005)
Main participants
Jihočeská univerzita v Českých Budějovicích / Přírodovědecká fakulta
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
13-01878S
Alternative language
Project name in Czech
Evoluční a ekologické faktory v evoluci genomu bakteriálních symbiontů hmyzu.
Annotation in Czech
Projekt se zabývá evolucí genomu symbiotických bakterií hmyzu v průběhu symbiogeneze. Porovnává několik linií hmyzích symbiontů rodů Arsenophonus a Sodalis s odlišnými ekologickými funkcemi v hostiteli (paraziti, fakultativní symbionti, obligátní mutualisti). Navazuje na výsledky předchozího výzkumu identifikujícího několik modelových systému s různou komplexitou - některé z nich jsou představovány jedním symbiontem, jiné komplexním společenstvem symbiotických bakterií. Hlavními charakteristikami srovnávací studie jsou: stupeň redukce a degenerace genomu, ztráty genů, struktura metabolických drah, horizontální přenos genů. Data pro srovnávací analýzy budou získána genomickými a transkriptomickými metodami a interpretována na pozadí fylogenetických vztahů a ekologických vlastností. Všechny vybrané symbiotické linie žijí ve vztahu s krevsajícím hmyzem čeledi Hippoboscidae. Tento výběr umožňuje srovnání s blízce příbuzným rodem Glossina (mouchy tsetse) a jeho symbionty.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
CEP classification - main branch
EH - Ecology - communities
CEP - secondary branch
EG - Zoology
CEP - another secondary branch
EB - Genetics and molecular biology
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>10613 - Zoology<br>10614 - Behavioral sciences biology<br>10615 - Ornithology<br>10616 - Entomology<br>10618 - Ecology<br>10619 - Biodiversity conservation<br>30101 - Human genetics
Completed project evaluation
Provider evaluation
U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)
Project results evaluation
The project has described several aspects of insect-bacteria symbiosis and their evolution. Important was introduction of Hippoboscidea to the cluster of insects with described bacterial symbiosis. As these flies are closely related to medically important tsetse flies with limited information about their symbioses, the project results give new approaches to the future tsetse studies.
Solution timeline
Realization period - beginning
Feb 1, 2013
Realization period - end
Dec 31, 2016
Project status
U - Finished project
Latest support payment
Apr 12, 2016
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP17-GA0-GA-U/03:1
Data delivery date
Jun 28, 2017
Finance
Total approved costs
7,980 thou. CZK
Public financial support
7,980 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK