Bacteria associated with blood-sucking arthropods: phylogeny and genome evolution
Project goals
The project deals with phylogenetic and genetic aspects of associations between bacteria and blood-feeding arthropods. The aims of the project are: 1) to investigate origin of bacteria inhabiting the tissues of selected arthropods (ticks, pupiparans, triatomine bugs, and lice) and to examine their relationships to pathogenic bacteria; 2) to screen the symbionts genomes for presence of "pathogenicity island" genes; 3) to study the genome changes associated with the symbiotic life-style (increase of ATcontent, gene loss, increase of non-synonymous/synonymous mutation rate). The purpose of these analyses is to achieve a deeper insight into the emergence and evolution of pathogenic and symbiotic associations between bacteria and blood-sucking
Keywords
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Standard projects
Call for proposals
Standardní projekty 6 (SGA02004GA-ST)
Main participants
—
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
—
Alternative language
Project name in Czech
Symbiotické bakterie krevsajících členovců: fylogeneze a evoluce genomu
Annotation in Czech
Projekt se zabývá vztahem mezi bakteriemi a krevsajícími členovci z fylogenetického a genetického hlediska. Cílem projektu je: 1) objasnit původ bakterií žijících v tkáních vybraných skupin členovců (klíšťat, dvoukřídlého hmyzu skupiny Pupipara, plošticpodčeledi Triatominae a vší) a studovat jejich vztah k patogenním bakteriím, 2) testovat genom symbiotických bakterií na přítomnost genů tzv. "pathogenicity islands", 3) studovat změny genomu spojené se symbiotickým způsobem života (zvyšování poměru AT bází, ztráta genů, zvyšování poměru nesynonymních a synonymních mutací). Smyslem těchto analýz je získání poznatků nutných k pochopení vzniku a vývoje patogenních a symbiotických vztahů mezi bakteriemi a krevsajícími členovci.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
CEP classification - main branch
EE - Microbiology, virology
CEP - secondary branch
EG - Zoology
CEP - another secondary branch
EB - Genetics and molecular biology
10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)
10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)
10605 - Developmental biology
10606 - Microbiology
10607 - Virology
10608 - Biochemistry and molecular biology
10609 - Biochemical research methods
10613 - Zoology
10614 - Behavioral sciences biology
10615 - Ornithology
10616 - Entomology
30101 - Human genetics
Completed project evaluation
Provider evaluation
V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)
Project results evaluation
Several groups of blood-sucking arthropods were screened for presence of symbiotic bacteria. Phylogenetic relationships of the symbionts were reconstructed using DNA sequences. Several bacterial lineages were identified in closely related families Anoplu
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2004
Realization period - end
Jan 1, 2006
Project status
U - Finished project
Latest support payment
—
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP07-GA0-GA-U/03:2
Data delivery date
Oct 16, 2007
Finance
Total approved costs
2,125 thou. CZK
Public financial support
2,125 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK
Basic information
Recognised costs
2 125 CZK thou.
Public support
2 125 CZK thou.
100%
Provider
Czech Science Foundation
CEP
EE - Microbiology, virology
Solution period
01. 01. 2004 - 01. 01. 2006