Foreign genetic material in Elymus repens and other Triticeae grasses: its nature, origin, and evolutionary implications.
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Standard projects
Call for proposals
Standardní projekty 17 (SGA0201300005)
Main participants
Botanický ústav AV ČR, v. v. i.<br>Ústav experimentální botaniky AV ČR, v. v. i.
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
13-04454S
Alternative language
Project name in Czech
Cizorodý genetický materiál v genomu Elymus repens a ostatních Triticeae: jeho charakteristika, původ a evoluční význam.
Annotation in Czech
Během nedávné studii jsme objevili přítomnost cizorodého genetického materiálu v genomu alohexaploidního druhu trávy Elymus repens (pýr plazivý, Pooideae-Triticeae) a některých dalších zástupců Triticeae. Některé ITS ribotypy, a také malý chromozomový segment, odpovídaly druhu Panicum (proso) z jiné podčeledi trav (Panicoideae-Paniceae). Tento fakt může být důsledkem dávné introgrese nebo horizontálního přenosu, nebo kombinace obou procesů. Cílem projektu je zjistit přítomnost, charakter, původ, a evoluční význam cizorodého genetického materiálu v rámci Triticeae za použití rozličných molekulárních a cytogenetických technik. Cizorodá DNA u vybraných zástupců Triticeae bude separována a analyzována zejména na přítomnost funkčních genů, které budou porovnány s homology u prosa. Jednotlivé ribotypy u pýru a dalších Triticeae budou kvantifikovány pomocí Real-Time PCR na úrovni jak DNA, tak RNA, za účelem zjištění jejich funkčnosti, dynamiky a úrovni exprese. Navrhovaný projekt může významnou měrou přispět k pochopení procesů a mechanismů probíhajících v rostlinných genomech.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
CEP classification - main branch
EF - Botany
CEP - secondary branch
—
CEP - another secondary branch
—
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
10611 - Plant sciences, botany<br>10612 - Mycology
Completed project evaluation
Provider evaluation
U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)
Project results evaluation
The project has brought information about transferring nuclear DNA among phylogenetically distant groups of vascular plants. Although the mode of transfer has not been identified, the results showed that the genomes of recipients can integrate and store diversity and quantity of foreign DNA for a long period of time. They introduced methods for the detection and characterization of foreign DNA.
Solution timeline
Realization period - beginning
Feb 1, 2013
Realization period - end
Dec 31, 2016
Project status
U - Finished project
Latest support payment
Apr 5, 2016
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP17-GA0-GA-U/03:1
Data delivery date
Jun 28, 2017
Finance
Total approved costs
9,185 thou. CZK
Public financial support
9,185 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK