All
All

What are you looking for?

All
Results
Organizations

Quick search

  • Projects supported by TA ČR
  • Excellent projects
  • Projects with the highest public support
  • Current projects

Smart search

  • That is how I find a specific +word
  • That is how I leave the -word out of the results
  • “That is how I can find the whole phrase”

Delivery of Polyomavirus genomes into the cell nucleus and interactions of their structural proteins in host cells

Project goals

Polyomaviruses, small tumorogenic DNA viruses replicate in the cell nucleus. Although intensively studied, their interactions with host cells structures and mechanism of uncoating and delivery of viral genomes into the cell nucleus are still poorly understood. The aims of the project is to fill up gaps in knowledge of the endocytic pathway used by mouse polyomvirus and human BK virus for virion trafficking towards the cell nucleus, to reveal interactions and functions of the minor structural proteins VP2 and VP3 of polyomaviruses in early events of virus infection and to contribute to understanding the mechanism of delivery of viral genomes into the cell nucleus. We propose to carry out an integrated structural, biochemical and functional analysis of the role of the polyomavirus minor proteins in these processes. Immuno-electron and confocal microscopy, live cell imaging, and biochemical analyses will be applied for detection of virus trafficking and visualisation of events taking place in nuclear and endoplasmic reticulum membranes.

Keywords

polyomavirusesVP2VP3 structural proteinsentry of viral genomes into the nucleusendocytosisvirus trafficking

Public support

  • Provider

    Czech Science Foundation

  • Programme

    Standard projects

  • Call for proposals

    Standardní projekty 17 (SGA0201300005)

  • Main participants

    Univerzita Karlova / Přírodovědecká fakulta

  • Contest type

    VS - Public tender

  • Contract ID

    13-26115S

Alternative language

  • Project name in Czech

    Doprava genomů polyomavirů do buněčného jádra a interakce strukturních proteinů v hostitelských buňkách

  • Annotation in Czech

    Malé tumorogenní DNA viry - polyomaviry - jsou replikovány v buněčném jádře. Ačkoliv intenzivně studovány, jejich interakce se strukturami hostitelské buňky a mechanismy dopravy jejich genomů do buněčného jádra jsou nejasné. Cílem projektu je vyplnit mezery v poznání endocytické dráhy využívané myším polyomavirem a lidským BK virem pro dopravu virionů k buněčnému jádru, odhalit interakce a funkce virových minoritních strukturních proteinů VP2 a VP3 v časných fázích infekce a přispět k pochopení mechanismů dopravy virových genomů do buněčného jádra. Bude provedena integrovaná strukturní, biochemická a funkční analýza interakcí a funkce polyomavirových minoritních strukturních proteinů. Imunoelektronová a fluorescenční mikroskopie a biochemické analýzy budou použity pro detekci produktivní endozomální dráhy a pro pozorování dějů probíhajících na jaderné membráně a membránách endoplasmatického retikula během dopravy virových genomů do jádra.

Scientific branches

  • R&D category

    ZV - Basic research

  • CEP classification - main branch

    FN - Epidemiology, infection diseases and clinical immunology

  • CEP - secondary branch

  • CEP - another secondary branch

  • 30302 - Epidemiology
    30303 - Infectious Diseases

Completed project evaluation

  • Provider evaluation

    U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)

  • Project results evaluation

    Results contribute to knowledge of interaction of virions and structural components with host cell structures during infection by mouse polyomavirus and to understanding virus trafficking and delivery of its genome into cell nucleus. Characteristics of results are adequate. Potential for development of antiviral drugs. 3 publications in prestigious journals, 1 in press.

Solution timeline

  • Realization period - beginning

    Feb 1, 2013

  • Realization period - end

    Apr 25, 2017

  • Project status

    U - Finished project

  • Latest support payment

    Apr 10, 2015

Data delivery to CEP

  • Confidentiality

    S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

  • Data delivery code

    CEP18-GA0-GA-U/02:1

  • Data delivery date

    May 4, 2018

Finance

  • Total approved costs

    7,539 thou. CZK

  • Public financial support

    7,539 thou. CZK

  • Other public sources

    0 thou. CZK

  • Non public and foreign sources

    0 thou. CZK

Basic information

Recognised costs

7 539 CZK thou.

Public support

7 539 CZK thou.

100%


Provider

Czech Science Foundation

CEP

FN - Epidemiology, infection diseases and clinical immunology

Solution period

01. 02. 2013 - 25. 04. 2017