Pyramidalization of the glycosidic nitrogen in nucleic acids; linking the structural phenomenon with chemistry of N-glycosidic bond cleavage
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Standard projects
Call for proposals
Standardní projekty 17 (SGA0201300005)
Main participants
Ústav organické chemie a biochemie AV ČR, v. v. i.
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
13-27676S
Alternative language
Project name in Czech
Pyramidalizace glykosidického dusíku v nukleových kyselinách; efekt pyramidalizace na chemii štěpení glykosidické vazby
Annotation in Czech
Tento teoretický projekt je zaměřený na strukturu nukleových kyselin, konkrétně na výzkum pyramidálního uspořádání glykosidického dusíku v nukleosidech a jeho roli v chemii štěpení glykosidické vazby 8-oxoguanosinu během odštěpení báze hOGG1 enzymem. Enzymatická oprava poškozených nukleových kyselin v buňce má vztah k rakovinnému onemocnění a k genetickým onemocněním obecně. Z hlediska medicínského a biologického je tedy tento výzkum zaměřen na pochopení základního obranného mechanizmu buňky, který participuje v těchto onemocněních.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
CEP classification - main branch
CF - Physical chemistry and theoretical chemistry
CEP - secondary branch
—
CEP - another secondary branch
—
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
10403 - Physical chemistry
Completed project evaluation
Provider evaluation
V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)
Project results evaluation
The project focused on theoretical modelling of chemical reactions involved in the enzymatic repair of the DNA molecules. The reaction mechanisms were studied primarily by means of QM/MM techniques, combined with advanced NMR experiments. The project allowed a detailed view on the repair mechanism.
Solution timeline
Realization period - beginning
Feb 1, 2013
Realization period - end
Dec 7, 2017
Project status
U - Finished project
Latest support payment
Apr 5, 2016
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP18-GA0-GA-U/02:1
Data delivery date
May 4, 2018
Finance
Total approved costs
3,632 thou. CZK
Public financial support
3,632 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK