A genomic approach to unravelling the biology and evolution of eustigmatophyte algae
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Standard projects
Call for proposals
Standardní projekty 17 (SGA0201300005)
Main participants
Biologické centrum AV ČR, v. v. i.<br>Ostravská univerzita / Přírodovědecká fakulta<br>Ústav molekulární genetiky AV ČR, v. v. i.
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
13-33039S
Alternative language
Project name in Czech
Genomický přístup k odhalování biologie a evoluce eustigmatofytních řas
Annotation in Czech
S výjimkou rodu Nannochloropsis známého pro své biotechnologické aplikace zůstává řasová třída Eustigmatophyceae nedostatečně studovanou skupinou, přestože se vyznačuje řadou zvláštních vlastností a obecným potenciálem pro biotechnologie. Náš recentní výzkum odhalil další dva významné aspekty biologie euatigmatofytů: fylogenetická diversita eustigmatofytů je mnohem větší, než se zdálo, a některé znaky a fylogenetické analýzy naznačují, že organismus příbuzným eustigmatofytům byl donorem plastidu pro plastid nesoucí alveolata (včetně medicínsky významných výtrusovců). Proto navrhujeme projekt průzkumu genomů a transkriptomů čtyř fylogeneticky odlišných eustigmatofytů s cílem osvětlit několik základních otázek biologie, genetiky a evoluce třídy Eustigmatophyceae. Genomická data získaná při řešení projektu poskytnou nenahraditelný zdroj pro širší vědeckou komunitu zabývající se biochemií, buněčnou biologií a evolucí eukaryotů, především řas, a vytvoří základ pro aplikovaný výzkum vedoucí k biotechnologickému využití eustigmatofytů mimo samotný rod Nannochloropsis.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
CEP classification - main branch
EF - Botany
CEP - secondary branch
—
CEP - another secondary branch
—
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
10611 - Plant sciences, botany<br>10612 - Mycology
Completed project evaluation
Provider evaluation
V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)
Project results evaluation
The results of this project bring new data about genome sequences of eustigmatophytes. They were published as 9 articles in highly impacted journals.
Solution timeline
Realization period - beginning
Feb 1, 2013
Realization period - end
Nov 24, 2016
Project status
U - Finished project
Latest support payment
Apr 1, 2016
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP17-GA0-GA-U/03:1
Data delivery date
Jun 28, 2017
Finance
Total approved costs
8,536 thou. CZK
Public financial support
8,536 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK