Molecular mechanisms and evolution of RNA polyadenylation in euglenophyte plastids
Project goals
Euglenophytes are a group of charismatic unicellular algae with plastids evolved via a complex process of secondary endosymbiosis. The model species, Euglena gracilis, has for long been employed in research on basic biological questions and is a promising resource for biotechnologies. Recently, genome-scale data and a method for targeted genetic manipulations have become available for Euglena. Building on these critical advances, previous work in the applicant’s lab, and new surprising insights, we propose to illuminate a poorly understood phenomenon of RNA polyadenylation in the euglenophyte plastid. We will combine diverse methods to define the characteristics of plastid RNA 3’-tails in E. gracilis, determine the distribution of plastid RNA polyadenylation in different euglenophyte groups, characterize candidates for plastid proteins involved in poly-/deadenylation, and put the plastid RNA polyadenylation into a broader functional and evolutionary context. The results will significantly advance our understanding of basic molecular processes in plastids in general.
Keywords
Euglenaplastid evolutionsecondary plastid3'terminal mRNA processingpolyadenylationnoncanonical PAP
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Standard projects
Call for proposals
SGA0202100005
Main participants
Ostravská univerzita / Přírodovědecká fakulta
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
21-19664S
Alternative language
Project name in Czech
Molekulární mechanismy a evoluce RNA polyadenylace v plastidech euglenofytů
Annotation in Czech
Euglenofyta jsou skupina charizmatických jednobuněčných řas s plastidem vzniklým složitým procesem sekundární endosymbiózy. Modelový druh Euglena gracilis je řadu let používán při zkoumání základních biologických otázek a navíc nabízí potenciál biotechnologického využití. Z velké části však zatím chybí znalosti ohledně molekulární biologie. Pouze nedávno byl popsán genom Eugleny a vypracována metoda cílených genetických manipulací. Na základě tohoto kritického pokroku, předchozích studií navrhovatele a nových překvapivých vhledů navrhujeme osvětlit málo probádaný fenomén polyadenylace RNA v plastidech euglenofytů. Pomocí kombinace různých metod definujeme charakteristiky 3’-konců RNA v plastidu E. gracilis, určíme distribuci plastidové RNA polyadenylace v různých skupinách euglenofytů, biochemicky charakterizujeme klíčové enzymy této dráhy a vše zasadíme do širšího funkčního a evolučního kontextu. Výsledky významně posunou naše znalosti o základních molekulárních procesech v plastidech obecně.
Scientific branches
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2021
Realization period - end
Dec 31, 2023
Project status
—
Latest support payment
Mar 6, 2023
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP24-GA0-GA-R
Data delivery date
May 21, 2024
Finance
Total approved costs
10,396 thou. CZK
Public financial support
10,119 thou. CZK
Other public sources
216 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK
Recognised costs
10 396 CZK thou.
Public support
10 119 CZK thou.
0%
Provider
Czech Science Foundation
OECD FORD
Genetics and heredity (medical genetics to be 3)
Solution period
01. 01. 2021 - 31. 12. 2023