Factors of genome stability in moss and flowering plants
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Standard projects
Call for proposals
Standardní projekty 20 (SGA0201600001)
Main participants
Masarykova univerzita / Přírodovědecká fakulta<br>Ústav experimentální botaniky AV ČR, v. v. i.
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
16-01137S
Alternative language
Project name in Czech
Faktory genomové stability u mechu a vyšších rostlin
Annotation in Czech
Nestabilita genomu a oprava DNA jsou aktuálními tématy výzkumu vzhledem k jejich těsnému spojení s procesy patogeneze, senescence, evoluce druhů nebo šlechtění rostlin. Zde navrhujeme komparativní zkoumání faktorů stability genomu u Physcomitrella patens a Arabidopsis thaliana k objasnění zúčastněných kontrolních mechanismů a k jejich rozlišení na specifické a obecné (konzervované mezi těmito evolučně vzdálenými rostlinnými druhy s rozdílnou účinností způsobů opravy zlomů v DNA). K řešení projektu bude využito kombinace molekulárně-biologických nástrojů vyvinutých u obou modelových organismů, včetně dostupných mutant, inovovaných genomických zdrojů, společně s obecnými metodami analýzy DNA-proteinových a protein-proteinových interakcí a dynamiky telomer. Současná zkušenost obou zúčastněných týmů se spoluprací na předchozím projektu, stejně jako znalosti a metodické zkušenosti vytvořené při řešení předchozího projektu budou aplikovány pro dosažení cílů navrženého projektu.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
CEP classification - main branch
EB - Genetics and molecular biology
CEP - secondary branch
GE - Plant cultivation
CEP - another secondary branch
—
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>30101 - Human genetics<br>40105 - Horticulture, viticulture<br>40106 - Agronomy, plant breeding and plant protection; (Agricultural biotechnology to be 4.4)
Completed project evaluation
Provider evaluation
V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)
Project results evaluation
Project solution brought new knowledge on the role of proteins involved in chromatin maintenance in the function and structure of telomeres, and considerably contributed to elucidation of mechanisms responsible for genome stability. Excellent level of research is documented by quantity of publications (13 papers) and by quality of journals as well (e.g. Cell Reports, Plant J, New Phytol etc.).
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2016
Realization period - end
Dec 31, 2018
Project status
U - Finished project
Latest support payment
Apr 26, 2018
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP19-GA0-GA-U/01:1
Data delivery date
Jun 12, 2019
Finance
Total approved costs
9,994 thou. CZK
Public financial support
9,449 thou. CZK
Other public sources
545 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK