Analyzing repair of toxic DNA-protein crosslinks in Arabidopsis
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Standard projects
Call for proposals
Standardní projekty 23 (SGA0201900001)
Main participants
Ústav experimentální botaniky AV ČR, v. v. i.
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
19-13848S
Alternative language
Project name in Czech
Analýza oprav toxických DNA-proteinových komplexů u huseníčku rolního
Annotation in Czech
Externí stres, specifické metabolity a některé vývojové procesy (např. meiotická rekombinace) vedou ke stabilnímu navázání proteinů na DNA a vzniku tzv. toxických DNA-proteinových vazeb (DPC). DPC představují fyzickou bariéru pro enzymy postupující podél DNA molekuly a narušují tak průběh replikace a transkripce, což může vést k poškození genomu nebo buněčné smrti. Způsob jakým dochází k opravám těchto poškození je v rostlinách téměř neznámý. V naší skupině jsme vyvinuli nový systém pro indukci enzymatických DPC v průběhu DNA replikace. Na základě tohoto systému jsme u modelové rostliny huseníčku rolního vytvořili genetický screen zaměřený na identifikaci genů zapojených do oprav DPC. V rámci projektové přípravy jsme zpracovali přibližně 10% mapovací populace a identifikovali několik kandidátních linií citlivých k DPC. V rámci těchto linií jsme již identifikovali dva geny, které představují nové faktory spojené s opravou DPC.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
OECD FORD - main branch
10601 - Cell biology
OECD FORD - secondary branch
—
OECD FORD - another secondary branch
—
CEP - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
EA - Morphology and cytology
Completed project evaluation
Provider evaluation
V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)
Project results evaluation
This is a very successful project, during the solution of which excellent results were achieved in the field of DNA damage repair mechanisms. The results significantly contributed to our understanding of the mechanisms involved in maintaining the stability of the plant genome. The achieved results were published in very prestigious international peer-reviewed journals.
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2019
Realization period - end
Jun 30, 2022
Project status
U - Finished project
Latest support payment
Apr 1, 2022
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP23-GA0-GA-U
Data delivery date
Jun 26, 2023
Finance
Total approved costs
7,651 thou. CZK
Public financial support
7,651 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK