Chromatin environment induced by genotoxic agents
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Junior Grants
Call for proposals
Juniorské granty 5 (SGA0201900002)
Main participants
Masarykova univerzita / Středoevropský technologický institut
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
19-11880Y
Alternative language
Project name in Czech
Chromatinové prostředí indukované genotoxickými látkami
Annotation in Czech
Poškození DNA vede k reorganizaci chromatinu, která je nezbytná k navedení poškozených míst do těsné blízkosti opravných proteinových komplexů, nutných pro efektivní opravu poškozené DNA. V rostlinách není zcela známo, jakými změnami na úrovni pozice nukleozomů, výměny histonových variant nebo skladby histonových modifikací, okolí poškozené DNA během opravy prochází. V tomto projektu budeme detailně studovat změny chromatinu způsobené inhibitorem topoisomerázy I, camptothecinem (CPT). Cílem bude určit, jakým způsobem je chromatin modulován, které oblasti genomu jsou skrze CPT přednostně ovlivněny a poškozeny, a která specifická dráha zprostředkovává odpověď na tato poškození DNA. V projektu budeme využívat rostlinných linií defektních v genech pro správné sestavování chromatinu, které vykazují citlivost/odolnost vůči CPT, a tak poslouží jako unikátní experimentální systém. Vzhledem k tomu, že CPT se používá k léčbě rakoviny a výsledek tohoto projektu přinese hlubší znalosti o buněčné odpovědi na stimulaci CPT, výsledky mohou být potenciálně využity také v klinickém výzkumu.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
OECD FORD - main branch
10611 - Plant sciences, botany
OECD FORD - secondary branch
—
OECD FORD - another secondary branch
—
CEP - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
EF - Botany
Completed project evaluation
Provider evaluation
V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)
Project results evaluation
New insights were gained into the response of chromatin to genotoxic agents in the Arabidopsis thaliana model. Among other things, the team demonstrated the role of the NAP1 protein in histone metabolism and identified the epigenetic profile of rDNA in the nucleus. The objectives of the project were fulfilled, the research resulted in 6 impacted publications in high quality journals.
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2019
Realization period - end
Dec 31, 2022
Project status
U - Finished project
Latest support payment
Apr 8, 2022
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP23-GA0-GJ-U
Data delivery date
Jun 26, 2023
Finance
Total approved costs
6,878 thou. CZK
Public financial support
6,878 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK