All

What are you looking for?

All
Projects
Results
Organizations

Quick search

  • Projects supported by TA ČR
  • Excellent projects
  • Projects with the highest public support
  • Current projects

Smart search

  • That is how I find a specific +word
  • That is how I leave the -word out of the results
  • “That is how I can find the whole phrase”

Chromatin environment induced by genotoxic agents

Public support

  • Provider

    Czech Science Foundation

  • Programme

    Junior Grants

  • Call for proposals

    Juniorské granty 5 (SGA0201900002)

  • Main participants

    Masarykova univerzita / Středoevropský technologický institut

  • Contest type

    VS - Public tender

  • Contract ID

    19-11880Y

Alternative language

  • Project name in Czech

    Chromatinové prostředí indukované genotoxickými látkami

  • Annotation in Czech

    Poškození DNA vede k reorganizaci chromatinu, která je nezbytná k navedení poškozených míst do těsné blízkosti opravných proteinových komplexů, nutných pro efektivní opravu poškozené DNA. V rostlinách není zcela známo, jakými změnami na úrovni pozice nukleozomů, výměny histonových variant nebo skladby histonových modifikací, okolí poškozené DNA během opravy prochází. V tomto projektu budeme detailně studovat změny chromatinu způsobené inhibitorem topoisomerázy I, camptothecinem (CPT). Cílem bude určit, jakým způsobem je chromatin modulován, které oblasti genomu jsou skrze CPT přednostně ovlivněny a poškozeny, a která specifická dráha zprostředkovává odpověď na tato poškození DNA. V projektu budeme využívat rostlinných linií defektních v genech pro správné sestavování chromatinu, které vykazují citlivost/odolnost vůči CPT, a tak poslouží jako unikátní experimentální systém. Vzhledem k tomu, že CPT se používá k léčbě rakoviny a výsledek tohoto projektu přinese hlubší znalosti o buněčné odpovědi na stimulaci CPT, výsledky mohou být potenciálně využity také v klinickém výzkumu.

Scientific branches

  • R&D category

    ZV - Basic research

  • OECD FORD - main branch

    10611 - Plant sciences, botany

  • OECD FORD - secondary branch

  • OECD FORD - another secondary branch

  • CEP - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)

    EF - Botany

Completed project evaluation

  • Provider evaluation

    V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)

  • Project results evaluation

    New insights were gained into the response of chromatin to genotoxic agents in the Arabidopsis thaliana model. Among other things, the team demonstrated the role of the NAP1 protein in histone metabolism and identified the epigenetic profile of rDNA in the nucleus. The objectives of the project were fulfilled, the research resulted in 6 impacted publications in high quality journals.

Solution timeline

  • Realization period - beginning

    Jan 1, 2019

  • Realization period - end

    Dec 31, 2022

  • Project status

    U - Finished project

  • Latest support payment

    Apr 8, 2022

Data delivery to CEP

  • Confidentiality

    S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

  • Data delivery code

    CEP23-GA0-GJ-U

  • Data delivery date

    Jun 26, 2023

Finance

  • Total approved costs

    6,878 thou. CZK

  • Public financial support

    6,878 thou. CZK

  • Other public sources

    0 thou. CZK

  • Non public and foreign sources

    0 thou. CZK