Origin and evolution of sex chromosomes in the dioecious plant Rumex acetosa
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Standard projects
Call for proposals
Standardní projekty 20 (SGA0201600001)
Main participants
Biofyzikální ústav AV ČR, v. v. i.
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
16-08698S
Alternative language
Project name in Czech
Původ a evoluce pohlavních chromozomů u dvoudomé rostliny Rumex acetosa
Annotation in Czech
Pohlavní chromozomy vznikly z páru autozomů jak u rostlin, tak u živočichů. Předpokládá se, že prvním krokem jejich evoluce je formování genů určujících pohlaví na proto-X(Z) a proto-Y(W) chromozomech, po kterém následuje omezení rekombinace v okolních oblastech a rychlá degenerace genů nacházejících se na chromozomu Y(W). Rumex acetosa (šťovík kyselý) je dvoudomá rostlina se systémem pohlavních chromozomů XX/XY1Y2. Předpokládá se, že tento systém vznikl buď rozštěpením původního Y chromozomu nebo translokací autozomu na původní X chromozom. V tomto projektu budeme testovat zmíněné hypotézy, abychom odhalili podstatu vzniku mnohočetných pohlavních chromozomů. Podrobné strukturní analýzy pomocí přímého sekvenování pohlavních chromozomů, cytogenetických analýz a kombinací klasických segregačních experimentů s masivním RNA sekvenováním umožní objasnit procesy stojící za formováním pohlavních chromozomů u tohoto druhu. Náš přístup umožní rychlé etablování rostlinného druhu R. acetosa jako standardního modelu pro další srovnávací analýzy.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
CEP classification - main branch
EF - Botany
CEP - secondary branch
EB - Genetics and molecular biology
CEP - another secondary branch
—
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>10611 - Plant sciences, botany<br>10612 - Mycology<br>30101 - Human genetics
Completed project evaluation
Provider evaluation
V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)
Project results evaluation
It was a very successful project that greatly advanced our understanding of sex chromosome evolution and gave rise to many excellent papers.
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2016
Realization period - end
Dec 11, 2020
Project status
U - Finished project
Latest support payment
May 16, 2018
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP21-GA0-GA-U/06:1
Data delivery date
Jun 30, 2021
Finance
Total approved costs
7,708 thou. CZK
Public financial support
6,847 thou. CZK
Other public sources
861 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK