Structure and synergism of fibrolytic enzymes in the rumen
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Standard projects
Call for proposals
Standardní projekty 20 (SGA0201600001)
Main participants
Ústav živočišné fyziologie a genetiky AV ČR, v. v. i.
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
16-12431S
Alternative language
Project name in Czech
Struktura a synergie fibrolytických enzymů v bachoru
Annotation in Czech
Cílem navrhovaného projektu je sledování a popis synergií glykobiomů bakteriálních rodů Butyrivibrio a Ruminococcus, dominantních složek G+ hemicelulolytické populace v bachoru. NGS sekvenování bude provedeno pomocí Ion Torrentu. Pozornost bude zaměřena na výskyt a vlastnosti hydrolytických enzymů, jejich zařazení do GH rodin, jejich vlastností a synergií jednotlivých hydrolas. Paralelně bude probíhat proteomická charakterizace produkovaných hemicelulas a celulas u izolátů zmíněných rodů s pomocí 2D elfo se zymogramovou detekcí aktivit β-1,4-endocelulas, β-1,4-xylanas a minoritních hemicelulas s následnou MS analýzou. Záměrem je objasnit mechanismus rozkladu vlákniny u vybraných izolátů, charakterizovat nepopsané glykosyl hydrolasy, zařazení do GH rodin, a jejich synergické chování. Cílem je selekce vybraných enzymů pro další aplikace. Bude popsána přítomnost nebo absence celulosomových nebo xylanosomových struktur, srovnání genetické příbuznosti a specifické aktivity celobiosofosforylas ve vybraných izolátech. U selektovaných enzymů bude stanovena struktura proteinů.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
CEP classification - main branch
EE - Microbiology, virology
CEP - secondary branch
GM - Food industry
CEP - another secondary branch
GH - Nutrition of farm animals
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
10606 - Microbiology<br>10607 - Virology<br>21101 - Food and beverages<br>40201 - Animal and dairy science; (Animal biotechnology to be 4.4)<br>40202 - Pets
Completed project evaluation
Provider evaluation
U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)
Project results evaluation
1. New knowledge on properties of xylanolytic and cellulotic enzymes from selected bacterial strains. 2. Result summary is correct. 3. The results can be use in other field, e.g. environmental protection (reduced production of CH4 and CO2). 4. Three publications in impacted journals. 5. Complies with regulations.
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2016
Realization period - end
Jul 22, 2020
Project status
U - Finished project
Latest support payment
Apr 16, 2018
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP21-GA0-GA-U/01:1
Data delivery date
Apr 12, 2021
Finance
Total approved costs
4,284 thou. CZK
Public financial support
4,032 thou. CZK
Other public sources
252 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK