Genomic dissection of barriers to gene flow in hybridising fire-bellied toads
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Standard projects
Call for proposals
Standardní projekty 20 (SGA0201600001)
Main participants
Ústav biologie obratlovců AV ČR, v. v. i.
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
16-26714S
Alternative language
Project name in Czech
Genomická disekce bariér toku genů u hybridizujících kuněk
Annotation in Czech
Proces vzniku druhů zahrnuje akumulaci genetických faktorů redukujících tok genů mezi populacemi. Na úrovni genomu si tento proces představujeme jako postupné šíření chromozomálních oblastí s omezenou introgresí, dokud tok genů zcela neustane. Navzdory intenzivnímu zájmu je dosud málo známo o kritickém intermediárním stadiu tohoto procesu mezi jeho začátkem a téměř úplným dokončením. Klasický systém hybridizace kuněk rodu Bombina nabízí unikátní vhled do této fáze speciačního kontinua: navzdory staré a hluboké divergenci B. bombina a B. variegata stále vytvářejí v rámci úzkých hybridních zón početné fertilní rekombinanty. Chceme vytvořit vazbovou mapu stávajících a nově vyvinutých genetických markerů a tuto mapu anotovat odhady introgresích rychlostí, QTL adaptivních znaků a faktorů redukujících fitness hybridů v experimentálních kříženích. To nám umožní testovat predikce o bariérách toku genů a vymezit možnosti pro ekologickou speciaci u Bombina. Pro tyto analýzy je k dispozici rozsáhlý archiv vzorků DNA z experimentálních křížení i terénních vzorků z Rumunské hybridní zóny.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
CEP classification - main branch
EG - Zoology
CEP - secondary branch
—
CEP - another secondary branch
—
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
10613 - Zoology<br>10614 - Behavioral sciences biology<br>10615 - Ornithology<br>10616 - Entomology
Completed project evaluation
Provider evaluation
O - Nesplněno zadání, smlouva však byla dodržena
Project results evaluation
Principal investigator managed to fulfil in prolonged term these main goals: 1. mapping of the genome of hybridizing frogs by full-genome sequencing, 2. development and defence of tadpoles. The project can contribute to a general understanding of the evolutionary importance of hybridisation of related species. No results were published yet. One article undergoes review and second is prepared.
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2016
Realization period - end
Dec 11, 2020
Project status
U - Finished project
Latest support payment
Apr 16, 2018
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP21-GA0-GA-U/01:1
Data delivery date
Apr 12, 2021
Finance
Total approved costs
6,080 thou. CZK
Public financial support
6,080 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK