Relationship between butanol efflux and butanol tolerance of Clostridia
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Standard projects
Call for proposals
Standardní projekty 21 (SGA0201700001)
Main participants
Vysoká škola chemicko-technologická v Praze / Fakulta potravinářské a biochemické technologie
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
17-00551S
Alternative language
Project name in Czech
Vztah mezi efluxem butanolu a tolerancí k butanolu u klostridií
Annotation in Czech
Projekt je zaměřen na studium úlohy membránových přenašečů (efluxových pump) v toleranci k rozpouštědlům u Gram pozitivních bakterií na příkladu butanolu a rozpouštědlotvorných klostridií. Geny potenciálních efluxových pump budou vybrány na základě bioinformatických analýz genomů sekvenovaných klostridií společně s RNA-seq a RT-qPCR transkriptomovými analýzami. Tyto geny budou využity pro získání mutantů nesoucích buď „over-expresi“ nebo „knock-out“. Získané mutanty budou testovány na změnu tolerance k butanolu a změny v transportu látek přes buněčnou membránu pomocí fluorescenčních technik, fluorimetrie a průtokové cytometrie. Kromě cílené mutageneze bude pro získání mutantů využita také technika laboratorní adaptivní evoluce, kdy bude eflux indukován nebo potlačen pomocí přídavku induktorů nebo inhibitorů efluxu. Data získaná pomocí RNA-seq techniky budou využita pro modelování signálních drah zodpovědných za eflux a toleranci k butanolu. Výsledky projektu přispějí k objasnění procesu exkrece rozpouštědel u Gram pozitivních bakterií.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
CEP classification - main branch
EE - Microbiology, virology
CEP - secondary branch
—
CEP - another secondary branch
—
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
10606 - Microbiology<br>10607 - Virology
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2017
Realization period - end
Dec 31, 2021
Project status
—
Latest support payment
Apr 26, 2019
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP21-GA0-GA-R/13:1
Data delivery date
Feb 22, 2021
Finance
Total approved costs
8,480 thou. CZK
Public financial support
7,895 thou. CZK
Other public sources
585 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK