Study of molecular mechanisms involved in suppression of transcription-associated genomic instability
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Standard projects
Call for proposals
Standardní projekty 21 (SGA0201700001)
Main participants
Ústav molekulární genetiky AV ČR, v. v. i.
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
17-02080S
Alternative language
Project name in Czech
Studium molekulárních mechanismů podílejících se na potlačení genetické nestability spojené s transkripcí
Annotation in Czech
Transkripce DNA může vést k nestabilitě genomu tím, že způsobuje kolaps replikačních vidlic, a to zejména za podmínek replikačního stresu, jež vyvolávají aktivované onkogeny v přednádorových lézích. Genetická nestabilita vyvolaná transkripcí je připisována tvorbě RNA:DNA hybridů, tzv. R-smyček, které vznikají při poruchách maturace primárních transkriptů a jako následek kolizí mezi transkripčními a replikačními komplexy. Abychom přispěli k lepšímu porozumění dosud nejasných mechanismů spojených s interferencí mezi transkripcí a replikací, její prevencí a odstraněním jejich následků, dáváme si za cíl: (i) identifikovat proteiny asociované s R-smyčkami tvořenými v podmínkách replikačního stresu, který zvyšuje pravděpodobnost interference mezi transkripcí a replikací; a (ii) definovat funkci identifikovaných proteinů při udržování genetické stability. Tato studie může odhalit nové biomarkery přednádorových lézích.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
CEP classification - main branch
EB - Genetics and molecular biology
CEP - secondary branch
—
CEP - another secondary branch
—
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>30101 - Human genetics
Completed project evaluation
Provider evaluation
U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)
Project results evaluation
This project was successfully finished and yielded 4 highly-relevant publications. Scientific contribution of the outputs to the field of RNA/DNA/transcription is high and internationally acknowledged. Results are summarized in this report and also presented in several international conferences. Five PhD students participated in this project, including research stays in the Swiss laboratory.
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2017
Realization period - end
Dec 31, 2019
Project status
U - Finished project
Latest support payment
Apr 10, 2019
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP20-GA0-GA-U/02:1
Data delivery date
Jul 23, 2020
Finance
Total approved costs
9,174 thou. CZK
Public financial support
7,836 thou. CZK
Other public sources
1,338 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK