Molecular mechanisms involved in reactivation of replication forks stalled by co-transcriptional R-loops
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Standard projects
Call for proposals
SGA0202200004
Main participants
Ústav molekulární genetiky AV ČR, v. v. i.
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
22-08294S
Alternative language
Project name in Czech
Molekulární mechanismy podílející se na reaktivaci replikačních vidlic zastavených ko-transkripčními R-smyčkami
Annotation in Czech
Konflikty mezi transkripčními a replikačními komplexy spojené s tvorbou RNA:DNA hybridů, tzv. R-smyček, jsou hlavní příčinou replikačního stresu a genetické nestability vedoucí k tvorbě zhoubných nádorů. Naše nedávná studie ukázala, že po regresi replikační vidlice indukované R-smyčkou může být obnovena semikonzervativní replikace mechanismem, který vyžaduje helikázy RECQ1 a RECQ5, endonukleázu MUS81, DNA ligázu IV, transkripční elongační faktor ELL a aktivní transkripci. V tomto projektu použijeme moderní metody molekulární a buněčné biologie společně s pokročilými technikami molekulárního zobrazování k prozkoumaní dosud nejasných molekulárních pochodů, které vedou k zastavení postupu replikační vidlice po strážce s transkripčním komplexem, a k zjištění, zda transkripční komplexy tvořící R-smyčku v místech těchto kolizí mohou obnovit syntézu RNA po naštěpení replikační vidlice MUS81 endonukleázou. Dále prozkoumáme role DNA topoizomerázy IIIβ a RECQ5 v procesech vedoucích k restartu replikace. Výsledky této studie mohou podpořit vývoj nových terapeutických přístupů k léčbě rakoviny.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
OECD FORD - main branch
10608 - Biochemistry and molecular biology
OECD FORD - secondary branch
—
OECD FORD - another secondary branch
—
CEP - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
CE - Biochemistry<br>EB - Genetics and molecular biology
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2022
Realization period - end
Dec 31, 2024
Project status
K - Ending multi-year project
Latest support payment
Mar 7, 2023
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP24-GA0-GA-R
Data delivery date
Feb 19, 2024
Finance
Total approved costs
9,986 thou. CZK
Public financial support
9,986 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK