Molecular mechanisms involved in removing R-loops at sites of interference between DNA transcription and replication
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Standard projects
Call for proposals
SGA0202500001
Main participants
Ústav molekulární genetiky AV ČR, v. v. i.
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
25-15542S
Alternative language
Project name in Czech
Molekulární mechanismy podílející se na odstraňování R-smyček v místech interference mezi DNA transkripcí a replikací
Annotation in Czech
Konflikty mezi procesy DNA transkripce a replikace způsobené tvorbou ko-transkripčních RNA:DNA hybridů, tzv. R-smyček, mohou vést ke genetické nestabilitě, a tak vyvolat vznik zhoubných nádorů. Zjistili jsme, že replikační vidlice zastavené R-smyčkou mohou být reaktivovány v procesu zprostředkovaném endonukleázou MUS81, DNA ligázou IV (LIG4) a transkripčním elongačním faktorem ELL. Cílem tohoto projektu je porozumět molekulárním mechanismům odpovědným za odstranění R-smyček v místech R-smyčkou zastavených replikačních vidlic, což je nezbytné pro restart DNA replikace prostřednictvím MUS81-LIG4-ELL dráhy. Již jsme identifikovali několik proteinů, včetně DNA helikáz FANCJ a RECQ5, RNA/DNA helikáz DDX17 a SETX a DNA topoizomerázy IIIβ, které by se mohly podílet na tomto procesu. V navrhovaném projektu budeme zkoumat kooperaci mezi těmito proteiny při odstraňovaní R-smyček v lidských buňkách a v rekonstituovaném systému in vitro. Výsledky tohoto projektu zlepší naše chápání základních mechanismů, které udržují genomovou stabilitu, a tak zabraňují vzniku rakoviny.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
OECD FORD - main branch
10608 - Biochemistry and molecular biology
OECD FORD - secondary branch
10601 - Cell biology
OECD FORD - another secondary branch
—
CEP - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
CE - Biochemistry<br>EA - Morphology and cytology<br>EB - Genetics and molecular biology
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2025
Realization period - end
Dec 31, 2027
Project status
Z - Beginning multi-year project
Latest support payment
—
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP25-GA0-GA-R
Data delivery date
Feb 21, 2025
Finance
Total approved costs
11,342 thou. CZK
Public financial support
11,342 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK