Exploring mechanisms of DNA replication restart upon collisions between transcription and replication complexes
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Standard projects
Call for proposals
Standardní projekty 23 (SGA0201900001)
Main participants
Ústav molekulární genetiky AV ČR, v. v. i.
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
19-07674S
Alternative language
Project name in Czech
Studium mechanismů reaktivace DNA replikace po kolizích mezi transkripčními a replikačními komplexy
Annotation in Czech
Kolize mezi transkripcí a replikací DNA představují významný zdroj genetické nestability v buňkách, které jsou vystaveny replikačnímu stresu. Ačkoliv jsou dobře známy strategie, které buňky vyvinuly k zabránění těchto kolizí, jak za těchto podmínek zastavená replikační vidlice restartuje DNA syntézu zůstává neobjasněno. Naše nedávné studie ukázaly, že reaktivace replikačních vidlic po kolizích s transkripčními komplexy spojených s tvorbou R-smyček závisí na MUS81 endonukleáze a DNA ligáze 4. V tomto projektu bychom chtěli využít proteomický přístup pro identifikaci a funkční charakterizaci nových proteinů zapojených do tohoto procesu. Zamýšlíme použít komponenty MUS81 endonukleázového komplexu, SLX4 a EME1, a kofaktor DNA ligázy 4, XRCC4, pro BioID-založené afinitní značení proteinů účastnících se restartu replikačních vidlic, což umožní jejich izolaci a identifikaci hmotnostní spektrometrií. Kandidátní proteiny budou podrobeny detailní funkční analýze k rozluštění jejich úlohy při reaktivaci DNA replikace.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
OECD FORD - main branch
10608 - Biochemistry and molecular biology
OECD FORD - secondary branch
—
OECD FORD - another secondary branch
—
CEP - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
CE - Biochemistry<br>EB - Genetics and molecular biology
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2019
Realization period - end
Dec 31, 2023
Project status
—
Latest support payment
Apr 30, 2021
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP22-GA0-GA-R
Data delivery date
Feb 22, 2022
Finance
Total approved costs
10,396 thou. CZK
Public financial support
9,563 thou. CZK
Other public sources
833 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK