Comparative parasite hybridisation genomics controlling for host divergence
Project goals
Parasite hybrid zones are understudied despite being natural laboratories for examining the mechanisms underlying host-parasite adaptation and specificity. A host natural system with pairwise contacts between taxa of different divergence times allows patterns of parasite genome introgression to be related to host divergence time. We propose to investigate the population genomic introgression patterns of the betaherpesviruses and the nematode Syphacia, parasites of the multimammate mouse, Mastomys natalensis, in Tanzania where 3 intraspecific taxa of the host meet and hybridize. We hypothesise that for both host and parasite barriers to introgression will increase with host pair divergence time, contacts between more closely related host taxa having wider clines in allele frequencies than contacts between more divergent taxa. This pattern should be even more pronounced for their parasites given their shorter generation time. Comparison of host/parasite genome-wide introgression patterns may, further, allow us to identify genes key to host-parasite interaction (e.g. “emergence” genes).
Keywords
Parasiteshybrid zonesgenomicsMastomys natalensisbetaherpesvirusesSyphacia pinwormtime of divergenceheterogeneous genome divergencedifferential introgression
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Standard projects
Call for proposals
Standardní projekty 22 (SGA0201800001)
Main participants
Ústav biologie obratlovců AV ČR, v. v. i.
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
18-19629S
Alternative language
Project name in Czech
Srovnávací genomika hybridizace parazitů s ohledem na míru divergence hostitelů
Annotation in Czech
Hybridní zóny parazitů jsou stále nedostatečně studovány navzdory tomu, že se jedná o unikátní přírodní laboratoře vhodné pro výzkum mechanismů vzniku adaptací a hostitelské specificity. Systém, ve kterém se potkávají populace hostitele s různou mírou divergence, umožňuje studovat vliv odlišnosti hostitele na míru introgrese diferencovaných genomů jeho parazitů. V projektu navrhujeme studovat tuto introgresi u betaherpesvirů a hlístic rodu Syphacia u hlodavců Mastomys natalensis. V Tanzánii se potkávají a hybridizují tři vnitrodruhové taxony tohoto hlodavce. Předpokládáme, že pro hostitele i parazita se budou bariéry introgrese zvyšovat s rostoucí divergencí hostitelských taxonů. Kontaktní zóny mezi příbuznějšími hostiteli budou mít širší kliny v alelických frekvencích než u taxonů evolučně vzdálenějších a tato patrnost by měla být ještě výraznější pro parazity, vzhledem k jejich kratší generační době. Srovnání vzoru genomické introgrese u hostitele i parazita nám umožní rovněž identifikovat klíčové geny pro interakce mezi hostiteli a jejich parazity (například geny tzv."emergence").
Scientific branches
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2018
Realization period - end
Dec 31, 2023
Project status
—
Latest support payment
Mar 25, 2020
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP22-GA0-GA-R
Data delivery date
Feb 22, 2022
Finance
Total approved costs
9,472 thou. CZK
Public financial support
9,117 thou. CZK
Other public sources
355 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK
Basic information
Recognised costs
9 472 CZK thou.
Public support
9 117 CZK thou.
96%
Provider
Czech Science Foundation
OECD FORD
Biology (theoretical, mathematical, thermal, cryobiology, biological rhythm), Evolutionary biology
Solution period
01. 01. 2018 - 31. 12. 2023