DIANA - the analytical method for the determination of enzyme inhibition
Project goals
We propose to develop an advanced high-throughput screening (HTS) pipeline for identification of potent inhibitors of medicinally relevant enzymes, such as carbonic anhydrase IX (CAIX), glutamate carboxypeptidase II (GCPII) or serine protease HIP1 from Mycobacterium tuberculosis. The pipeline will employ our unique methodology based on DNA-labelled active site probe (DIANA), which offers superior sensitivity, accuracy and dynamic range compared to other currently used HTS methods. The identified hit compounds with novel scaffolds will be verified using established enzyme kinetic assays. New inhibitors of these enzymes may open new avenues in primary research and represent promising drug candidates in a variety of cancer types. Ultimately, the newly developed HTS assay will represent a universal screening platform for other pharmaceutically relevant targets.
Keywords
inhibitorhigh-throughput screeningCAIXcarbonic anhydraseglutamate carboxypeptidase IIGCPIIPSMAqPCR
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Standard projects
Call for proposals
Standardní projekty 23 (SGA0201900001)
Main participants
Ústav organické chemie a biochemie AV ČR, v. v. i.
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
19-10280S
Alternative language
Project name in Czech
DIANA - analytická metoda pro stanovení inhibic enzymů
Annotation in Czech
Navrhujeme vývoj pokročilé HTS (high-throughput screening) metodiky pro identifikaci účinných inhibitorů medicinálně významných enzymů, např. karbonické anhydrasy IX (CAIX) a glutamátkarboxypeptidasy II (GCPII) nebo serinové proteasy HIP1 z Mycobacterium tuberculosis. Metodika bude využívat naši unikátní technologii založenou na sondě značené DNA, vázající se do aktivního místa enzymů (DIANA), která poskytuje vynikající citlivost, přesnost a dynamický rozsah ve srovnání s jinými používanými HTS metodami. Nalezené struktury budou ověřeny pomocí zavedených enzymových testů. Nově identifikované inhibitory mohou otevírat nové směry v základním výzkumu a zároveň být slibnými kandidáty pro vývoj nových léčiv. Nově vytvořená HTS metodika pak bude představovat univerzální technologii pro další farmaceuticky významné cíle.
Scientific branches
Completed project evaluation
Provider evaluation
U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)
Project results evaluation
The project solution brought the expected knowledge in the field of enzyme inhibitors detection and a sufficient number of outputs (5 papers in IF journals, patent filed, 1 Ph.D. thesis, participation of another 4 Ph.D. students). The quality of outputs and contribution to knowledge in the field of analytical chemistry did not reach the highest level in comparison with other projects.
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2019
Realization period - end
Dec 31, 2021
Project status
U - Finished project
Latest support payment
May 12, 2021
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP22-GA0-GA-U
Data delivery date
Jun 29, 2022
Finance
Total approved costs
5,295 thou. CZK
Public financial support
4,944 thou. CZK
Other public sources
351 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK
Recognised costs
5 295 CZK thou.
Public support
4 944 CZK thou.
0%
Provider
Czech Science Foundation
OECD FORD
Biochemical research methods
Solution period
01. 01. 2019 - 31. 12. 2021