Novel role of PPM1D/Wip1 phosphatase in chromatin organization
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Standard projects
Call for proposals
Standardní projekty 23 (SGA0201900001)
Main participants
Ústav molekulární genetiky AV ČR, v. v. i.
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
19-15962S
Alternative language
Project name in Czech
Nová funkce PPM1D/Wip1 fosfatázy v organizaci chromatinu
Annotation in Czech
Genotoxický stres aktivuje signální dráhu DNA damage response (DDR), která koordinuje zástavu progrese buněčným cyklem s opravou DNA. Tumorsupresorový protein p53 je integrální součástí této přirozené bariéry chránící buňky před rozvojem nestability genomu a vznikem nádorů. Protein fosfatáza Wip1 (kódovaná genem PPM1D) potlačuje funkci p53 a po dokončení opravy DNA ukončuje aktivitu DDR dráhy. Kromě inhibice p53, Wip1 defosforyluje některé proteiny ovlivňující organizaci heterochromatinu a telomer. Kombinací chromatinové imunoprecipitace, profilování exprese genů a funkčních esejů plánujeme studovat vliv Wip1 na organizaci chromatinu. Konkrétně se zaměříme na vliv Wip1 na depozici histonu H3.3, methylaci histonů a umlčování heterochromatinu. Dále budeme studovat vliv deplece a zvýšené exprese Wip1 na organizaci telomer. Předpokládáme, že tento projekt povede k nalezení nových molekulárních mechanismů umlčování heterochromatinu a udržování telomer v lidských buňkách.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
OECD FORD - main branch
10601 - Cell biology
OECD FORD - secondary branch
—
OECD FORD - another secondary branch
—
CEP - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
EA - Morphology and cytology
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2019
Realization period - end
Dec 31, 2023
Project status
—
Latest support payment
Apr 30, 2021
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP22-GA0-GA-R
Data delivery date
Feb 22, 2022
Finance
Total approved costs
6,998 thou. CZK
Public financial support
6,656 thou. CZK
Other public sources
342 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK