Chemical modulation of Ku activity and its use in genome editing.
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Standard projects
Call for proposals
Standardní projekty 23 (SGA0201900001)
Main participants
Masarykova univerzita / Středoevropský technologický institut
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
19-21961S
Alternative language
Project name in Czech
Chemická modulace aktivity Ku komplexu a využití v editaci genomů.
Annotation in Czech
Integrita genomu je řízena několika mechanismy, mezi kterými jsou nejsložitější dráhy zabývající se zlomenými konci DNA. Kvůli své silné vazebné aktivitě na DNA konce je Ku jednou z klíčových molekul zapojených do metabolismu DNA zlomů. Je nezbytná pro opravu DNA pomocí nehomologického koncového spojování, ale je také nezbytná pro integritu telomer. Díky své důležité funkci při udržování genomu zkoumání Ku otevírá zajímavé možnosti v oblasti biotechnologie a medicíny. Doposud byla funkce Ku modifikována geneticky, protože nejsou k dispozici žádné chemické inhibitory. Zde navrhujeme studovat mechanismus interakce Ku-DNA s důrazem na C-terminální SAP doménu Ku70. Dále chceme provést screening chemických knihoven k identifikaci sloučenin, které inhibují vazbu Ku na DNA. Identifikované inhibitory budou biochemicky charakterizovány a testovány na jejich biologickou aktivitu in vivo. Nakonec zjistíme, zda tyto sloučeniny ovlivňují účinnost při cílení genů a spektrum mutací indukovaných CRISPR / Cas9 v rostlinných buňkách.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
OECD FORD - main branch
10608 - Biochemistry and molecular biology
OECD FORD - secondary branch
—
OECD FORD - another secondary branch
—
CEP - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
CE - Biochemistry<br>EB - Genetics and molecular biology
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2019
Realization period - end
Dec 31, 2023
Project status
—
Latest support payment
Apr 30, 2021
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP22-GA0-GA-R
Data delivery date
Feb 22, 2022
Finance
Total approved costs
8,922 thou. CZK
Public financial support
8,430 thou. CZK
Other public sources
492 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK