Structural and biochemical insights into miscoding by the eukaryotic ribosome.
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Standard projects
Call for proposals
SGA0202000001
Main participants
Mikrobiologický ústav AV ČR, v. v. i.
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
20-00579S
Alternative language
Project name in Czech
Strukturální a biochemický vhled do nepřesného dekódování eukaryotickým ribozómem
Annotation in Czech
Nedávné studie odhalily přímou účast glutaminové tRNA v pročítání stop kodonu. Překvapivé je, že účinnost pročítání není pro všechny izoformy Glu-tRNA stejná. Nejvyšší účinnost má izoforma M, která jako jediná nese antikodon CUG. Všechny ostatní izoformy nesou UUC antikodon a jejich účinky jsou zanedbatelné. Ačkoliv primární sekvence všech izoforem se liší pouze v několika nukleotidech, předběžné výsledky ukázaly, že vyšší účinnost pročítání isoformy M je daná právě její primární sekvencí. Tento návrh si klade za cíl biochemicky i strukturálně probádat, jaké nukleotidové báze a jaké modifikace těchto bází přispívají ke zvýšené stabilizaci isoformy M v ribozomálním A-místě. Domníváme se totiž, že právě zvýšená stabilita umožnuje této isoformě vysoce účinné pročítání. Dále plánujeme prověřit potenciální přínos několika malých ribozomálních proteinů, které tvoří A-místo, k výše zmíněné stabilizaci Glu-tRNA v A-místě. Nakonec se pokusíme zjistit, jestli nám takto nabyté znalosti pomohou objasnit molekulární mechanismus zvýšeného pročítání rovněž u zbývajících pročítání-indukujících tRNA.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
OECD FORD - main branch
10606 - Microbiology
OECD FORD - secondary branch
—
OECD FORD - another secondary branch
—
CEP - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
EE - Microbiology, virology
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2020
Realization period - end
Dec 31, 2022
Project status
—
Latest support payment
Apr 8, 2022
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP23-GA0-GA-R
Data delivery date
Jun 26, 2023
Finance
Total approved costs
8,154 thou. CZK
Public financial support
8,154 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK