PHOTO-INITIATED CHEMICAL CROSS-LINKING & ELECTRON RELEASE: METHODS FOR STRUCTURE FUNCTIONAL STUDY OF PROTEINS
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Standard projects
Call for proposals
SGA0202000001
Main participants
Univerzita Karlova / Přírodovědecká fakulta
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
20-28126S
Alternative language
Project name in Czech
Světlem iniciované chemické síťování a uvolnění elektronu: metody pro strukturně funkční studium proteinů
Annotation in Czech
V projektu bude vyvýjena a aplikována kombinace hmotnostní spektrometrie s dvěma metodickými postupy pro strukturně-funkční studium proteinů: (i) světlem indukované zesítění (PIXL) pro popis oligomerizace v nativním stavu při in vivo a in vitro experimentech, (ii) světlem indukovaného uvolnění elektronu (PIER) pro studium přenosu elektronů. V projektu bude použito několik strukturních analogů methioninu s fotolabilní skupinou: např. L 2 amino-5,5-azi-hexanová kyselina či (S)-2-amino-4-azido-butanová kyselina, které budou zabudovány do sekvence studovaného rekombinantního proteinu během exprese v minerálním mediu v auxotrofním kmeni E. coli B834 (využití chybovosti aminoacyl-tRNA-synthasy). Projekt bude řešit dvě klinicky relevantní témata pomocí metodik PIXL a PIER: (i) interakce zodpovědné za invasivní bakteriální patogenesi B. pertussis způsobenou CyaA, (ii) procesy způsobující oligomerizaci při elektron transportní aktivitě azurinu (měď vázající elektrotransportní modrý metaloprotein z P. aeruginosa).
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
OECD FORD - main branch
10609 - Biochemical research methods
OECD FORD - secondary branch
—
OECD FORD - another secondary branch
—
CEP - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
CE - Biochemistry<br>EB - Genetics and molecular biology
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2020
Realization period - end
Jun 30, 2023
Project status
—
Latest support payment
Apr 1, 2023
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP24-GA0-GA-R
Data delivery date
May 21, 2024
Finance
Total approved costs
5,921 thou. CZK
Public financial support
5,921 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK