Dynamics and thermodynamics of mouse pheromone-protein complexes
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Standard projects
Call for proposals
Standardní projekty 1 (SGA02002GA-ST)
Main participants
Masarykova univerzita / Přírodovědecká fakulta
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
—
Alternative language
Project name in Czech
Studium dynamiky a termodynamiky komplexů myších feromonů s proteiny
Annotation in Czech
Navrhovaný projekt je zaměřen na studium změn dynamiky proteinů v důsledku vazby feromonů. Myší MUP-I, zkoumaný spolunavrhovatelem, byl vybrán jako modelový protein. Dynamické parametry popisující pohyby amidových vazeb budou stanoveny z relaxačních datpro volný protein a protein s navázaným feromonem a jeho analogy. Po zavedení pokročilých technik izotopového značení (značení 13C s částečnou deuterací) budou dynamická měření rozšířena na C-H vazby postranních řetězců. Vliv vazby ligandů na konformačníentropii bude stanoven z hodnot parametru uspořádání (order parameter) a srovnán s kalorimetrickými daty. Výpočetní metody budou využity k určení ostatních změn volné energie v důsledku vazby ligandů. Struktury volného MUP-I a komplexu MUP-I s navázanýmferomonem budou určeny pomocí NMR v roztoku a srovnány s krystalovými strukturami získanými v laboratoři spolunavrhovatele. Aplikace zmíněné metodologie na proteiny příbuzné MUP, které se podílí na transportu feromonů k jejich neuronovým receptorům, je
Scientific branches
R&D category
—
CEP classification - main branch
CF - Physical chemistry and theoretical chemistry
CEP - secondary branch
CE - Biochemistry
CEP - another secondary branch
—
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
10403 - Physical chemistry<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods
Completed project evaluation
Provider evaluation
U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)
Project results evaluation
Byla vyvinuta nová metodika analýzy relaxačních dat pomocí studií teplotních závislostí redukovaných funkcí spektrální hustoty s využitím 15N 1H relaxačních dat v isotopicky značených proteinech. Jednalo se o velmi komplikovaná a časově náročná měření (m
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2000
Realization period - end
Jan 1, 2002
Project status
U - Finished project
Latest support payment
—
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP/2003/GA0/GA03GA/U/N/9:7
Data delivery date
May 19, 2008
Finance
Total approved costs
4,290 thou. CZK
Public financial support
2,875 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK