Effects of drugs on radiation induced damages of DNA
Public support
Provider
Academy of Sciences of the Czech Republic
Programme
Grants of distinctly investigative character focused on the sphere of research pursued at present particularly in the Academy of Sciences of the Czech Republic
Call for proposals
—
Main participants
Ústav jaderné fyziky AV ČR, v. v. i.
Contest type
—
Contract ID
—
Alternative language
Project name in Czech
Vliv ligandů na radiačně indukovaná poškození DNA
Annotation in Czech
Projekt je zaměřen na teoretické modelování účinku ionizujícího záření (IZ) na komplexy DNA s různými ligandy (interkalátory, ligandy v malé a velké rýze). Navrhovaný přístup využívá dříve vytvořený teoretický model, který simuluje účinek volných radikálů vzniklých radiolýzou prostředí obklopujícího studovanou DNA. Model je založen na simulační metodě Monte Carlo (simulace vzniku a difuse radikálů) a teorii Smoluchowského (chemické reakce radikálů s DNA a ligandy). Třídimensionální atomické struktury komplexů DNA-ligand používané v simulacích budou získány buďto z databank (PDB, NDB) a nebo budou určeny molekulárním modelováním pomocí minimalizace energie studovaných komplexů (program SYBYL). Pravděpodobnosti reakcí radikálů s reačními místy DNA a ligandů budou porovnávány s parametry struktury komplexů a dostupnými experimentálními daty. Výsledky budou analyzovány s ohledem na výtěžky a závažnost poškození DNA způsobených IZ.
Scientific branches
R&D category
—
CEP classification - main branch
BO - Biophysics
CEP - secondary branch
CE - Biochemistry
CEP - another secondary branch
EB - Genetics and molecular biology
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>10610 - Biophysics<br>30101 - Human genetics
Completed project evaluation
Provider evaluation
U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)
Project results evaluation
Teoretický model RADACK byl upravaen a aplikován pro simulace nepřímého účinku ionizujícího záření na DNA interagující s různými ligandy. Konfrontací s experimentálními daty byl vysvětlen vliv struktury komplexů na výtěžky a distribuce poškození.
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 1999
Realization period - end
Jan 1, 2000
Project status
U - Finished project
Latest support payment
—
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP/2001/AV0/AV01IA/U/N/4:2
Data delivery date
—
Finance
Total approved costs
282 thou. CZK
Public financial support
226 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK