Radiolytic damage of DNA bases
Public support
Provider
Academy of Sciences of the Czech Republic
Programme
The research grant projects for juniors
Call for proposals
Juniorské badatelské grantové projekty 2 (SAV02004-J)
Main participants
Ústav jaderné fyziky AV ČR, v. v. i.
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
—
Alternative language
Project name in Czech
Poškození bází DNA produkty radiolýzy vody
Annotation in Czech
Poškození bází DNA patří mezi nejzávažnější poškození DNA účinkem ionizujícího záření. Projekt je zaměřen na teoretické simulace reakcí produktů radiolýzy (OH, H, eaq-) s jednotlivými bázemi, nukleosidy a krátkými fragmenty DNA. Difúze radikálů vzniklýchradiolýzou prostředí bude simulována metodou Monte Carlo, reakce radikálů s jednotlivými atomy bází a deoxyribózy budou modelovány podle teorie Smoluchowského. Pravděpodobnosti reakcí radikálů s jednotlivými bázemi, nukleosidy, a oligonukleotidy DNA budou porovnány s dostupnými výtěžky modifikovaných bází vystavených účinkům ionizujícího záření nebo jiným oxidačním činidlům. Cílem práce je určit rozdíl v reaktivitě bází DNA vyskytujících se samostatně a nebo v makromolekule DNA. Bude také stanoven vlivokolních bází a dynamiky dvoušroubovice DNA.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
CEP classification - main branch
CE - Biochemistry
CEP - secondary branch
BO - Biophysics
CEP - another secondary branch
—
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>10610 - Biophysics
Completed project evaluation
Provider evaluation
U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)
Project results evaluation
Probabilities of OH? radical reaction with base atoms obtained by theoretical calculations were compared to exper. yields of radiolytically damaged bases. The reactivity of particular atoms and the whole individual bases and within DNA were determined.
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2004
Realization period - end
Jan 1, 2005
Project status
U - Finished project
Latest support payment
—
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP06-AV0-KJ-U/07:5
Data delivery date
Feb 12, 2014
Finance
Total approved costs
278 thou. CZK
Public financial support
278 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK