All
All

What are you looking for?

All
Results
Organizations

Quick search

  • Projects supported by TA ČR
  • Excellent projects
  • Projects with the highest public support
  • Current projects

Smart search

  • That is how I find a specific +word
  • That is how I leave the -word out of the results
  • “That is how I can find the whole phrase”

Study of structure and dynamical properties of macromolecules by methods of X-ray diffraction and computer simulation

Project goals

The aim of submitted project is: (1) Determine a three-dimensional atomic structure of selected bio-macromolecules (mutated HIV protease) and of complexes with ligands, by methods of x-ray diffraction. The experimentally determined structures will contribute to explanation of interaction between the enzyme and inhibitor or substrate and they will support the further development of potential drugs based on enzyme inhibition (inhibition of HIV protease prevents multiplication of the virus that causes thedisease AIDS). (2) Verify possibilities of application of time resolved x-ray structural analysis on explanation of dynamical properties of enzymes (e.g. HIV protease). (3) Apply methods of computer simulations (molecular dynamics, etc) on explanation ofenzyme dynamics (HIV protease), namely at substrate or product binding or release. Methods of x-ray diffraction enable study of biological macromolecules structures at atomic resolution and so contribute to explanation of structure-functio

Keywords

Public support

  • Provider

    Czech Science Foundation

  • Programme

    Standard projects

  • Call for proposals

    Standardní projekty 1 (SGA02002GA-ST)

  • Main participants

    Ústav makromolekulární chemie AV ČR, v. v. i.

  • Contest type

    VS - Public tender

  • Contract ID

Alternative language

  • Project name in Czech

    Studium struktury a dynamických vlastností makromolekul metodami rentgenové difrakce a počítačové simulace

  • Annotation in Czech

    Cílem projektu je stanovit 3D atomární struktury vybraných biomakromolekul (mutovaná HIV proteáza) a komplexů těchto molekul s ligandy, s pomocí rentgenové difrakce. Experimentálně zjištěné struktury přispějí k objasnění interakce enzymu s inhibitorem ase substrátem a pomohou tak při vývoji potenciálních léčiv založených na inhibici enzymů (inhibice HIV proteázy zamezuje množení viru HIV, který je příčinou onemocnění AIDS). Ověřit možnosti aplikace rentgenografické strukturní analýzy s časovým rozlišením na objasnění dynamických vlastností enzymů (HIV proteáza). Aplikovat metody počítačové simulace (molekulární dynamika apod.) na objasnění dynamického chování enzymů (HIV proteázy), zejména při vazbě substrátu nebo uvolnění produktu reakce. Metody rentgenové difrakce umožňují studium struktury biologických makromolekul v atomárním rozlišení a tím přispívají k objasnění vztahu mezi strukturou a funkcí významných biochemických mechanismů např. u enzymů (HIV proteáza). Vývoj léčiv proti AIDS s

Scientific branches

  • R&D category

  • CEP classification - main branch

    CE - Biochemistry

  • CEP - secondary branch

  • CEP - another secondary branch

  • 10608 - Biochemistry and molecular biology
    10609 - Biochemical research methods

Completed project evaluation

  • Provider evaluation

    U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)

  • Project results evaluation

    Byly získány významné výsledky a projekt tak přispěl k úspěšnému řešení nosného grantu garanta. Závěrečná karta informuje objektivně o průběhu řešení a jeho výsledcích, které byly nebo budou publikovány v mezinárodních časopisech (1 článek již publikovan

Solution timeline

  • Realization period - beginning

    Jan 1, 2000

  • Realization period - end

    Jan 1, 2003

  • Project status

    S - Stopped (prematurely terminated) multi-year project

  • Latest support payment

Data delivery to CEP

  • Confidentiality

    S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

  • Data delivery code

    CEP/2002/GA0/GA02GA/U/N/7:3

  • Data delivery date

    Apr 1, 2003

Finance

  • Total approved costs

    432 thou. CZK

  • Public financial support

    322 thou. CZK

  • Other public sources

    144 thou. CZK

  • Non public and foreign sources

    0 thou. CZK