Uncoupling of DNA restriction and DNA translocation functions of EcoR124I restriction-modification enzyme - a potential melecular motor
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Standard projects
Call for proposals
Standardní projekty 2 (SGA02003GA-ST)
Main participants
Mikrobiologický ústav AV ČR, v. v. i.
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
—
Alternative language
Project name in Czech
Rozpřažení DNA restrikční a DNA translokační funkce restrikčně-modifikačního enzymu EcoR124I - potenciálního molekulárního motoru
Annotation in Czech
Schopnost restrikčně-modifikačních enzymů translokovat DNA před vlastním štěpením činí z těchto enzymů inteligentní molekulární motor. Máme zkušenosti s komplexním enzymem EcoR124I, který se vyskytuje v bakteriální buňce ve formě dvou komplexů R1M2S1 aR2M2S1, jež jsou ve vzájemné rovnováze. Komplex obsahující jen jednu podjednotku HsdR není schopen štěpit DNA, ale zachovává si schopnost DNA translokovat. Tím se nabízí možnost studovat tento enzym jako molekulární motor bez problémů spojených srestrikcí.Je však známo, že za určitých okolností i R1-komplex může štěpit DNA. Abychom zcela odstranili tuto možnost chceme se zaměřit na řízenou mutagenezi tří konzervovaných aminokyselinových zbytků endonukleasového motivu podjednotky HsdR. Schopnostmutantníhoenzymu translokovat DNA přes membránu budeme analyzovat in vitro pomocí membranových váčků. Bude studována možnost využití elongačního faktoru Tu jako molekulárního spínače v regulaci molekulárního motoru EcoR124I.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
CEP classification - main branch
EE - Microbiology, virology
CEP - secondary branch
EB - Genetics and molecular biology
CEP - another secondary branch
—
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10606 - Microbiology<br>10607 - Virology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>30101 - Human genetics
Completed project evaluation
Provider evaluation
U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)
Project results evaluation
Type I restriction-modification enzymes able to translocate DNA preceding restriction, in process driven by their own ATPase activity, represent an important molecular motors. The HsdR motor subunit has amino-acid sequence motifs typical of the superfami
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2003
Realization period - end
Jan 1, 2005
Project status
U - Finished project
Latest support payment
—
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP06-GA0-GA-U/07:6
Data delivery date
Jan 15, 2009
Finance
Total approved costs
2,153 thou. CZK
Public financial support
2,153 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK