The role of repetitive DNA sequences in evolution of sex chromosomes in plants
Project goals
The existence and evolution of sex chromosomes is a basic question in evolutionary biology. This topic is of general importance, especially in the light of recent discoveries concerning the human Y chromosome. While the majority of animal sex chromosomesare ancient, dioecious plants represent an ideál model to study the early steps of sex chromosome evolution. The Y chromosome represents a bizarre part of the genomes, non-recombining, and thus assexual. We propose to study the role of repetitive DNA sequences in the evolution of sex chromosomes in the model dioecious plant Silene latifolia, because repeats are probably responsible for the huge size of the Y chromosome. We will study the accumulation of promiscuous plastid and mitochondrial DNA as wellas tandem repeats on the Y chromosome, a phenomenon which is indicated by our preliminary results. We will also study a new retrotransposon carrying tandem repeats to reveal a unique mechanism of tandem repeats amplification in the genomes.
Keywords
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Standard projects
Call for proposals
Standardní projekty 8 (SGA02005GA-ST)
Main participants
—
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
204/05/2097
Alternative language
Project name in Czech
Úloha repetitivních sekvencí DNA v evoluci pohlavních chromosomů rostlin
Annotation in Czech
Vznik a evoluce pohlavních chromosomů je jednou ze základních otázek evoluční biologie. Toto téma je vysoce aktuální, zejména ve světle nejnovějších objevů týkajících se lidského pohlavního chromosomu Y. Zatímco pohlavní chromosomy většiny živočichů jsouevolučně staré, dvoudomé rostliny jsou ideální pro studium časných fází evoluce pohlavních chromosomů. Unikátní je především chromosom Y, představující část genomu, která nerekombinuje a je tudíž asexuální. Našim cílem bude studovat úlohu repetitivních sekvencí DNA v evoluci pohlavních chromosomů modelového dvoudomého druhu Silene latifolia, neboť repetice zřejmě stojí v pozadí značné velikosti chromosomu Y. Budeme studovat akumulaci promiskuitní plastidové a mitochondiální DNA, jakož i tandemových repeticí na chromosomu Y, kterou naznačují naše předběžné výsledky. Dále budeme studovat nový retrotransposon nesoucí tandemovou repetici, z hlediska odhalení možného mechanizmu šíření repeticí po genomech. Dále využijeme časté asociace DNA transposonů
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
CEP classification - main branch
EB - Genetics and molecular biology
CEP - secondary branch
EF - Botany
CEP - another secondary branch
GE - Plant cultivation
10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)
10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)
10605 - Developmental biology
10608 - Biochemistry and molecular biology
10609 - Biochemical research methods
10611 - Plant sciences, botany
10612 - Mycology
30101 - Human genetics
40105 - Horticulture, viticulture
40106 - Agronomy, plant breeding and plant protection; (Agricultural biotechnology to be 4.4)
Completed project evaluation
Provider evaluation
V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)
Project results evaluation
While sex chromosomes in mammals are ancient, sex chromosomes in dioecious plants are in the early stages of evolution. Silene latifolia is the best studied model dioecious plant with evolutionary young sex chromosomes where the Y chromosome is the large
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2005
Realization period - end
Dec 31, 2007
Project status
U - Finished project
Latest support payment
May 2, 2007
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP08-GA0-GA-U/04:3
Data delivery date
Dec 16, 2008
Finance
Total approved costs
2,497 thou. CZK
Public financial support
2,497 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK
Basic information
Recognised costs
2 497 CZK thou.
Public support
2 497 CZK thou.
100%
Provider
Czech Science Foundation
CEP
EB - Genetics and molecular biology
Solution period
01. 01. 2005 - 31. 12. 2007