The role of repetitive DNA sequences in evolution of sex chromosomes in plants
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Standard projects
Call for proposals
Standardní projekty 8 (SGA02005GA-ST)
Main participants
—
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
204/05/2097
Alternative language
Project name in Czech
Úloha repetitivních sekvencí DNA v evoluci pohlavních chromosomů rostlin
Annotation in Czech
Vznik a evoluce pohlavních chromosomů je jednou ze základních otázek evoluční biologie. Toto téma je vysoce aktuální, zejména ve světle nejnovějších objevů týkajících se lidského pohlavního chromosomu Y. Zatímco pohlavní chromosomy většiny živočichů jsouevolučně staré, dvoudomé rostliny jsou ideální pro studium časných fází evoluce pohlavních chromosomů. Unikátní je především chromosom Y, představující část genomu, která nerekombinuje a je tudíž asexuální. Našim cílem bude studovat úlohu repetitivních sekvencí DNA v evoluci pohlavních chromosomů modelového dvoudomého druhu Silene latifolia, neboť repetice zřejmě stojí v pozadí značné velikosti chromosomu Y. Budeme studovat akumulaci promiskuitní plastidové a mitochondiální DNA, jakož i tandemových repeticí na chromosomu Y, kterou naznačují naše předběžné výsledky. Dále budeme studovat nový retrotransposon nesoucí tandemovou repetici, z hlediska odhalení možného mechanizmu šíření repeticí po genomech. Dále využijeme časté asociace DNA transposonů
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
CEP classification - main branch
EB - Genetics and molecular biology
CEP - secondary branch
EF - Botany
CEP - another secondary branch
GE - Plant cultivation
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>10611 - Plant sciences, botany<br>10612 - Mycology<br>30101 - Human genetics<br>40105 - Horticulture, viticulture<br>40106 - Agronomy, plant breeding and plant protection; (Agricultural biotechnology to be 4.4)
Completed project evaluation
Provider evaluation
V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)
Project results evaluation
While sex chromosomes in mammals are ancient, sex chromosomes in dioecious plants are in the early stages of evolution. Silene latifolia is the best studied model dioecious plant with evolutionary young sex chromosomes where the Y chromosome is the large
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2005
Realization period - end
Dec 31, 2007
Project status
U - Finished project
Latest support payment
May 2, 2007
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP08-GA0-GA-U/04:3
Data delivery date
Dec 16, 2008
Finance
Total approved costs
2,497 thou. CZK
Public financial support
2,497 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK