Automac interpretation of electron density maps for structure genomics
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Standard projects
Call for proposals
Standardní projekty 9 (SGA02006GA-ST)
Main participants
—
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
204/06/1007
Alternative language
Project name in Czech
Automatická interpretace map elektronové hustoty pro strukturní genomiku
Annotation in Czech
Cílem projektu je vývoj automatického expertního systému a počítačového programu na interpretaci map elektronové hustoty a na automatické budování strukturních modelů v krystalografii proteinů a nukleových kyselin. Tento systém je potřebný pro vysoko-rychlostní strukturní analýzu v strukturní genomice a také jako možná náhrada počítačových grafických modelu (např. XtalView, QUANTA nebo O). Tento systém pomůže eliminovat pracné manuální budování modelu na pracovních grafických stanicích a odstraní úzký profil v projektu strukturní genomiky.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
CEP classification - main branch
FR - Pharmacology and apothecary chemistry
CEP - secondary branch
—
CEP - another secondary branch
—
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
30104 - Pharmacology and pharmacy
Completed project evaluation
Provider evaluation
U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)
Project results evaluation
The project is a part of structure biology. It solves problems of automated model building of proteins and nucleic acids in protein crystallography. New methods, algorithms and computer programs have been developed. In the field of structure bioinformati
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2006
Realization period - end
Dec 31, 2008
Project status
U - Finished project
Latest support payment
Apr 25, 2008
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP09-GA0-GA-U/02:2
Data delivery date
Oct 22, 2009
Finance
Total approved costs
695 thou. CZK
Public financial support
695 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK