Study of RNA Editing in Transcripts from Maxicircle Kinetoplast DNA of Trypanosoma Carassii, Trypanosoma Boissoni and Bodo Caudatus (Kinetoplastida).
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Standard projects
Call for proposals
—
Main participants
Parazitologický ústav AV ČR
Contest type
—
Contract ID
—
Alternative language
Project name in Czech
Studium RNA editingu v transkriptech kinetoplastové DNA u Trypanosoma carassii, Trypanosoma boissoni a Bodo caudatus /Kinetoplastida/
Annotation in Czech
Cílem projektu je studium evolučních původů RNA editingu, procesu, který byl objeven v mitochondriích některých prvoků řádu Kinetoplastida.Pro naší práci jsme vybrali dva zástupce podřádu Trypanosomatina (Trypanosoma carasii a T.boissoni)a jednoho zástupce podřádu Bodonina (Bodo caudutus).Fylogenetická příbuznost všech těchto druhů s ostatními známými zástupci řádu Kinetoplastida bude založena na porovnávání sekvencí cytochromoxidázových podjednotek (cox) I a II.Nepřímo se pokusíme detekovat přítomnostebo nepřítomnost RNA editingu užitím polyadeninových oligonukleotidů, které zajistí cDNA syntézu na U-koncích guide RNA (malé molekuly RNA nesoucí informace o editingu).Možnost mezidruhové variace editingu bude studována u T. carassii a t. boissoni, kteébyly vybrány pro tento účel, protože předpokládáme určitou evoluční příbuznost s lépe prostudovanými kinetoplastidy.Zároveň počítáme s tím,že naše výsledky přispějí k doplnění obecného modelu pro RNA editing.
Scientific branches
R&D category
—
CEP classification - main branch
EE - Microbiology, virology
CEP - secondary branch
9H - 9
CEP - another secondary branch
CE - Biochemistry
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
10606 - Microbiology<br>10607 - Virology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 1994
Realization period - end
Jan 1, 1996
Project status
U - Finished project
Latest support payment
—
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP/1997/GA0/GA07GA/V/9:7
Data delivery date
—
Finance
Total approved costs
300 thou. CZK
Public financial support
450 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK