Conformational polymorphism and expansion fo the (CNG)n and related microsatellite DNA sequences

Provider

Czech Science Foundation

Programme

Standard projects

Call for proposals

—

Main participants

Biofyzikální ústav AV ČR, v. v. i.

Contest type

—

Contract ID

—

Project name in Czech

Konformační polymorfie a prodlužování mikrosatelitů (CNG)n a příbuzných sekvencí v DNA

Annotation in Czech

Konformační polymorfie je pravděpodobnou příčinou prodlužování mikrosatelitů v genomech. Toto prodlužování v některých případech vede k závažným, zejména neuro-degenerativním onemocněním. V tomto projektu navrhujeme studovat na modelových molekulách DNAkonformační vlastnosti trinukleotidových a příbuzných, zejména tetranukleotidových mikrosatelitů a tyto konformační vlastnosti korelovat s jejich prodlužováním při replikaci in vitro. K tomuto účelu použijeme CD a UV absorpční spektroskopii, polyakrylamidovou gelovou elektroforézu, PCR a případně další metody. Výsledky projektu přispějí k pochopení mechanismů prodlužování mikrosatelitů v genomech a úlohy konformační polymorfie DNA v tomto prodlužování.

R&D category

—

CEP classification - main branch

EB - Genetics and molecular biology

CEP - secondary branch

—

CEP - another secondary branch

—

OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)

10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>30101 - Human genetics

Provider evaluation

U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)

Project results evaluation

Prodlužování mikrosatelitů (CNG)n v lidském genomu je fenomén, způsobující řadu závažných onemocnění. Výsledky řešení ukázaly, že a) mikrosatelity mohou mít různou konformaci, b) popsány byly detaily změn u satelitu z genu pro protein chrupavky, c) překv

Realization period - beginning

Jan 1, 1998

Realization period - end

Jan 1, 2000

Project status

U - Finished project

Latest support payment

—

Confidentiality

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Data delivery code

CEP/2001/GA0/GA01GA/U/N/9:4

Data delivery date

—

Total approved costs

2,404 thou. CZK

Public financial support

1,775 thou. CZK

Other public sources

0 thou. CZK

Non public and foreign sources

0 thou. CZK