Analysis of syntenic group of genes conserved between mammals and invertebrates by molecular genetics methods
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Standard projects
Call for proposals
—
Main participants
Ústav molekulární genetiky AV ČR, v. v. i.
Contest type
—
Contract ID
—
Alternative language
Project name in Czech
Molekulárně genetická analýza syntenní skupiny genů konzervované mezi savci a bezobratlými
Annotation in Czech
V průběhu pozičního klonování genu Hybrid sterility I (Hst) na myším chromozomu 17 jsme zjistili, že existuje syntenní skupina genů konzervovaná v genomu člověka, myši a bezobratlých. Poprvé tak byla nalezena skupina syntenních genů, bez zjevné společnéfunkce, která se dá sledovat až do genomu Caenorhabditis elegans a Drosophily melanogaster. Cílem navrhovaného projektu je analyzovat geny námi objevené syntenní skupiny, mapovat nové geny do této skupiny a pokusit se nalézt důvody pro její konzervaci. Projekt hodláme realizovat ve dvou krocích. V prvním kroku chceme lokalizovat nové geny na myší chromozom 17 pomocí lidských genů ze syntenní oblasti, transkripčním mapováním oblasti kolem Hst 1 genu a hledáním v databázích. Ve druhém kroku, který závisína výsledcích prvního, hodláme určit orientaci genů a jejich isochory a mapovat chromatinové smyčky u sousedících syntenních genů. Použijeme metod "exon trapping" nebo cDNA selekce nových genů Hst 1 oblasti. Realizace projektu povede k charakterizaci sku
Scientific branches
R&D category
—
CEP classification - main branch
EB - Genetics and molecular biology
CEP - secondary branch
—
CEP - another secondary branch
—
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>30101 - Human genetics
Completed project evaluation
Provider evaluation
V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)
Project results evaluation
Postup a metodika prací je v souladu se stanoveným záměrem. Grant přinesl významná zjištění pro genomiku, spočívající ve srovnávání vlastností genomů bezobratlých a myši. Byly předloženy přesvědčivé důkazy syntemie mezi evolučně velmi vzdálenými organizm
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 1998
Realization period - end
Jan 1, 2000
Project status
U - Finished project
Latest support payment
—
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP/2001/GA0/GA01GA/U/N/9:4
Data delivery date
—
Finance
Total approved costs
805 thou. CZK
Public financial support
718 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK