Genome size and karyotype evolution in Cyperaceae
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Standard projects
Call for proposals
Standardní projekty 12 (SGA02009GA-ST)
Main participants
—
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
206-09-1405
Alternative language
Project name in Czech
Evoluce karyotypu a velikosti genomu v čeledi Cyperaceae
Annotation in Czech
Hlavním cílem projektu je analýza patternů genomických parametrů: (i) velikost genomu, (ii) počet chromosomů, (iii) velikost chromosomů, (iv) genomový AT/GC poměr, (v-vi) diverzita a dominance retrotransposonů u taxonů dvou kontrastních modelových rodů sholokinetickými chromosomy Carex a Eleocharis. Evoluční dynamika těchto druhově specifických genomických parametrů v rámci fylogeneze založené na molekulárních sekvenčních znacích bude využita ke zhodnocení role klíčových mechanizmů evoluce velikosti genomu: (i) polyploidie; (ii) agmatoploidie, (iii) symploidie, (iv-v) amplifikace a eliminace retrotransposonů v hlavních evolučních liniích studovaných taxonů. Modelem není tudíž konkrétní druh jako v klasických genomických studiích, ale skupina druhů spojená sítí jejich evoluční příbuznosti. Modelové rody jsou kontrastní v (i) druhové diverzitě, (ii) evolučních centrech, (iii) ekologické diverzifikaci, ale hlavně v (iv) rozsahu velikosti chromosomů a genomů, který je u Eleocharis jeden z největších v rámci krytosemenných rodů se známou velikostí genomu a počtem chromosomů.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
CEP classification - main branch
EF - Botany
CEP - secondary branch
—
CEP - another secondary branch
—
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
10611 - Plant sciences, botany<br>10612 - Mycology
Completed project evaluation
Provider evaluation
V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)
Project results evaluation
The project identified key mechanisms in karyotype and genome size evolution in genera Carex and Eleocharis, improved the algorithm for inferring phylogenetic trees and revealed major phylogenetical trends distinguishing holocentric caryotypes from monocentric ones. The project yielded numerous outcomes, majority of them published in highly recognized journals.
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2009
Realization period - end
Dec 31, 2012
Project status
U - Finished project
Latest support payment
Apr 1, 2012
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP13-GA0-GA-U/02:3
Data delivery date
May 17, 2016
Finance
Total approved costs
6,538 thou. CZK
Public financial support
6,538 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK