Genetic and epigenetic consequences of chromosome editing in Arabidopsis thaliana model plant
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Standard projects
Call for proposals
SGA0202200004
Main participants
Masarykova univerzita / Středoevropský technologický institut
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
22-04364S
Alternative language
Project name in Czech
Genetické a epigenetické důsledky editace chromozomů v modelové rostlině Arabidopsis thaliana
Annotation in Czech
Metody cílené editace genomů jsou využívány v rostlinném výzkumu s cílem získat odrůdy s výhodnými fenotypovými vlastnostmi. S využitím systému CRISPR/Cas9 byly získány rostliny Arabidopsis thaliana s translokovanými konci chromozomových ramen. Naše předběžné pokusy ukázaly, že v T4 generaci se vyskytli jedinci s výraznými fenotypovými defekty, přičemž všechny analyzované rostliny v předchozích generacích byly standardního fenotypu. Tento modelový systém umožňuje studium dlouhodobých důsledků reorganizace chromozomů pro fenotyp rostlin a organizaci chromatinu v jádře. Navrhujeme studovat expresi genů a strukturu chromatinu v rostlinách s translokovanými konci chromozomů a rozdílným fenotypem. Analýza telomer na jednotlivých ramenech chromozomů bude využita k řešení přetrvávající záhady v biologii chromozomů – jakým mechanismem je určena specifická délka telomer na jednotlivých ramenech chromozomů. Výstupy projektu budou užitečné pro aplikaci metod editace genomů a chromozomů ve šlechtitelských programech.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
OECD FORD - main branch
10608 - Biochemistry and molecular biology
OECD FORD - secondary branch
—
OECD FORD - another secondary branch
—
CEP - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
CE - Biochemistry<br>EB - Genetics and molecular biology
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2022
Realization period - end
Dec 31, 2024
Project status
B - Running multi-year project
Latest support payment
May 19, 2022
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP23-GA0-GA-R
Data delivery date
Feb 20, 2023
Finance
Total approved costs
4,809 thou. CZK
Public financial support
4,809 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK