Blastocrithidia and Trypanosoma as optimal models for testing the emergence and features of alternative genetic codes
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Standard projects
Call for proposals
SGA0202200004
Main participants
Biologické centrum AV ČR, v. v. i.
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
22-14356S
Alternative language
Project name in Czech
Parazitičtí prvoci Blastocrithidia a Trypanosoma jako optimální modely pro testování vzniku a vlastností alternativních genetických kódů
Annotation in Czech
Genetický kód není absolutně univerzální, neboť se objevuje rostoucí počet jeho variant v mitochondriálních, prokaryotických a eukaryotických genomech. Nejčastěji se změny týkají stop kodónů. Nedávno jsme izolovali a na úrovni morfologie, genomu, transkriptomu a proteomu popsali nového prvoka Blastocrithidia nonstop, v němž všechny tři stop kodóny kódují aminokyseliny. Tato drastická úchylka od standartního kódu je umožněna dosud neznámou změnou tRNA, která patrně vznikla i v řadě dalších eukaryot. Tento projekt si klade za cíl objasnit, jak terminační faktory a struktura tRNA regulují translaci u nestandartních kódů. Blastocrithidia a příbuzná Trypanosoma se standartním kódem představují ideální modely pro analýzu evoluce genetického kódu a odhalení jejích důsledků pro translační mechanismy. Pomocí molekulárních a bioinformatických metod chceme objasnit procesy, které umožňují vznik a fungování neortodoxních nebo nejednoznačných genetických kódů.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
OECD FORD - main branch
10608 - Biochemistry and molecular biology
OECD FORD - secondary branch
10606 - Microbiology
OECD FORD - another secondary branch
30310 - Parasitology
CEP - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
CE - Biochemistry<br>EB - Genetics and molecular biology<br>EE - Microbiology, virology<br>FP - Other medical fields
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2022
Realization period - end
Dec 31, 2025
Project status
P - Interrupted multi-year project
Latest support payment
Jul 9, 2024
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP25-GA0-GA-R
Data delivery date
Feb 21, 2025
Finance
Total approved costs
9,794 thou. CZK
Public financial support
9,505 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK