Horizontal gene transfer network in chicken gut microbiome: detection and prediction of antibiotic resistome and mobilome
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Standard projects
Call for proposals
SGA0202200004
Main participants
Vysoké učení technické v Brně / Fakulta elektrotechniky a komunikačních technologií
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
22-16786S
Alternative language
Project name in Czech
Horizontální přenos genů v kuřecím střevním mikrobiomu: detekce a predikce antibiotického rezistomu a mobilomu
Annotation in Czech
V komerčních chovem byla antibiotika po desetiletí podávána jako preventivní léčba u nově vylíhnutých kuřat z důvodu jejich náchylnosti k invazivním patogenům v prvních dnech života. To mělo za následek selekční tlak na komenzální bakterie, které se těmto změnám přizpůsobily získáním genů rezistence k antibiotikům (ARG) mechanismem horizontálního přenosu. Pro střevní mikrobiotu je charakteristická intenzivní výměna genů mezi bakteriemi, proto je považována za rezervoár ARG. Hlavním cílem tohoto návrhu je charakterizovat klíčové mobilní elementy kuřecí střevní mikrobioty, geny rezistence k antibiotikům a plazmidy pomocí kombinace genomických a současných metagenomických přístupů. Dále určíme, které bakteriální taxony jsou spojeny s šířením mobilních genetických elementů. Zároveň objevíme nové geny rezistence k antibiotikům díky systematickému klonování metagenomické DNA a následnému fenotypickém screeningu a sekvenování.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
OECD FORD - main branch
40301 - Veterinary science
OECD FORD - secondary branch
—
OECD FORD - another secondary branch
—
CEP - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
GJ - Diseases and animal vermin, veterinary medicine
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2022
Realization period - end
Dec 31, 2024
Project status
K - Ending multi-year project
Latest support payment
Mar 6, 2023
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP24-GA0-GA-R
Data delivery date
Feb 19, 2024
Finance
Total approved costs
9,838 thou. CZK
Public financial support
9,838 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK