All

What are you looking for?

All
Projects
Results
Organizations

Quick search

  • Projects supported by TA ČR
  • Excellent projects
  • Projects with the highest public support
  • Current projects

Smart search

  • That is how I find a specific +word
  • That is how I leave the -word out of the results
  • “That is how I can find the whole phrase”

Horizontal gene transfer network in chicken gut microbiome: detection and prediction of antibiotic resistome and mobilome

Public support

  • Provider

    Czech Science Foundation

  • Programme

    Standard projects

  • Call for proposals

    SGA0202200004

  • Main participants

    Vysoké učení technické v Brně / Fakulta elektrotechniky a komunikačních technologií

  • Contest type

    VS - Public tender

  • Contract ID

    22-16786S

Alternative language

  • Project name in Czech

    Horizontální přenos genů v kuřecím střevním mikrobiomu: detekce a predikce antibiotického rezistomu a mobilomu

  • Annotation in Czech

    V komerčních chovem byla antibiotika po desetiletí podávána jako preventivní léčba u nově vylíhnutých kuřat z důvodu jejich náchylnosti k invazivním patogenům v prvních dnech života. To mělo za následek selekční tlak na komenzální bakterie, které se těmto změnám přizpůsobily získáním genů rezistence k antibiotikům (ARG) mechanismem horizontálního přenosu. Pro střevní mikrobiotu je charakteristická intenzivní výměna genů mezi bakteriemi, proto je považována za rezervoár ARG. Hlavním cílem tohoto návrhu je charakterizovat klíčové mobilní elementy kuřecí střevní mikrobioty, geny rezistence k antibiotikům a plazmidy pomocí kombinace genomických a současných metagenomických přístupů. Dále určíme, které bakteriální taxony jsou spojeny s šířením mobilních genetických elementů. Zároveň objevíme nové geny rezistence k antibiotikům díky systematickému klonování metagenomické DNA a následnému fenotypickém screeningu a sekvenování.

Scientific branches

  • R&D category

    ZV - Basic research

  • OECD FORD - main branch

    40301 - Veterinary science

  • OECD FORD - secondary branch

  • OECD FORD - another secondary branch

  • CEP - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)

    GJ - Diseases and animal vermin, veterinary medicine

Solution timeline

  • Realization period - beginning

    Jan 1, 2022

  • Realization period - end

    Dec 31, 2024

  • Project status

    K - Ending multi-year project

  • Latest support payment

    Mar 6, 2023

Data delivery to CEP

  • Confidentiality

    S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

  • Data delivery code

    CEP24-GA0-GA-R

  • Data delivery date

    Feb 19, 2024

Finance

  • Total approved costs

    9,838 thou. CZK

  • Public financial support

    9,838 thou. CZK

  • Other public sources

    0 thou. CZK

  • Non public and foreign sources

    0 thou. CZK