Interaction and structural changes of retroviral MA domain of Gag due to plasma membrane binding and implications for the virus maturation
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Standard projects
Call for proposals
SGA0202200004
Main participants
Vysoká škola chemicko-technologická v Praze / Fakulta potravinářské a biochemické technologie
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
22-19250S
Alternative language
Project name in Czech
Interakce a strukturní změny retrovirové MA domény Gag během vazby na cytoplasmatickou membránu a důsledky pro zrání viru
Annotation in Czech
Současná terapie prodloužila životy lidí žijících s HIV, ale poskytuje malou šanci na jejich úplné vyléčení. Na rozdíl od SARS-CoV-2 je malá naděje na účinné očkování proti HIV. Díky vysokému počtu HIV pozitivních schopných přenášet onemocnění se vytváří nové kmeny rezistentní na léky. To ospravedlňuje výzkum důležitých, přesto nevysvětlených kroků v životním cyklu retrovirů, které by mohly být terapeuticky cíleny. Proto plánujeme popsat rozdíly v afinitě k membráně a ve vazebných rozhraních matrixové domény (MA) polyproteinu Gag a MA po proteolytickém oddělení během zrání virů u HIV-1, Mason-Pfizer opičího viru (M-PMV) a viru Rousova sarkomu, tj. virů s různými typy morfogeneze a motivy pro interakci s membránou. Rovněž plánujeme identifikovat mechanismy spouštějící C-terminální štěpení MA u M-PMV a HIV-1. K tomu použijeme metody molekulární biologie zahrnující NMR, termoforézu, fluorescenční anizotropii a nové metody strukturní proteomiky, jako je výměna vodík/deuterium a kovalentní prokřížení, obě kombinované s hmotnostní spektrometrií s vysokým rozlišením.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
OECD FORD - main branch
10608 - Biochemistry and molecular biology
OECD FORD - secondary branch
—
OECD FORD - another secondary branch
—
CEP - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
CE - Biochemistry<br>EB - Genetics and molecular biology
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2022
Realization period - end
Dec 31, 2024
Project status
K - Ending multi-year project
Latest support payment
Mar 10, 2023
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP24-GA0-GA-R
Data delivery date
Feb 19, 2024
Finance
Total approved costs
7,755 thou. CZK
Public financial support
7,199 thou. CZK
Other public sources
443 thou. CZK
Non public and foreign sources
88 thou. CZK