Structure of retroviral particle and intracellular transport of its components.
Public support
Provider
Ministry of Education, Youth and Sports
Programme
KONTAKT II
Call for proposals
KONTAKT II 2 (SMSM2012LH2)
Main participants
Vysoká škola chemicko-technologická v Praze / Fakulta potravinářské a biochemické technologie
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
MSMT-6805/2013-311
Alternative language
Project name in Czech
Struktura retrovirové částice a intracelulární transport jejích komponent
Annotation in Czech
Připravit vektory pro expresi mutantů obalového glykoproteinu M-PMV s pozměněným transportem, modifikované fluorescenční značkou pro sledování intracelulární lokalizace v živočišných buňkách. Využít mikroskopické metody ?Live imaging? zavedené v US laboratoři pro analýzu pohybu značených proteinů v buňkách ko-transfekovaných mutanty virových glykoproteinů a fluorescenčně značených strukturních proteinů kapsidy. Připravit in vitro částice tří retrovirů, porovnat jejich strukturu a určit rozdíly v uspořádání do oligomerní sítě či kapsomer. Jedná se o charakteristické zástupce různých skupin (HIV, RSV a M-PMV) s různým uspořádáním strukturních proteinů. Studovat oligomerizaci matrixového proteinu M-PMV a porovnat sílu vazby s mutanty aberantně transportovanými či s pozdrženým uvolňováním z membrány. Připravit myristoylovaný MA pro strukturní studie krystalizací na membráně a pomocí NMR spektroskopie. Studovat interakci MA s membránovými složkami.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
CEP classification - main branch
EE - Microbiology, virology
CEP - secondary branch
EB - Genetics and molecular biology
CEP - another secondary branch
FN - Epidemiology, infection diseases and clinical immunology
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10606 - Microbiology<br>10607 - Virology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>30101 - Human genetics<br>30302 - Epidemiology<br>30303 - Infectious Diseases
Completed project evaluation
Provider evaluation
V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)
Project results evaluation
"We resolved M-PMV structures of capsid protein (CA), myristoylated matrix protein and its complex with phosphatidylinositol of cytoplasmic membrane (CM). Microtubules and endosomes play a role in transport of immature virus (ICAPs). Env interaction with ICAPs initiates transport of endosomes to the CM. Otherwise, Env is recycled to GA. RKK motif of CA mediates incorporation of viral RNA. We prepared modified ICAPs specifically introducing genes into tumor cells."
Solution timeline
Realization period - beginning
Mar 1, 2012
Realization period - end
Dec 31, 2015
Project status
U - Finished project
Latest support payment
Feb 27, 2015
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP16-MSM-LH-U/01:1
Data delivery date
Oct 9, 2017
Finance
Total approved costs
1,990 thou. CZK
Public financial support
1,990 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK